RNA id: TCONS_00051348


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00051348
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_026332
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 24745766 ~ 24745881 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tgccacagccatatcaccctgcagcccaagacccagactcactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctggataggtgaccacatggaaaaactatgttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175597

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00053015 lncRNA downstream 694912 23701286 ~ 24050854 (-) False XLOC_026322
TCONS_00053014 lncRNA downstream 695476 23701286 ~ 24050290 (-) False XLOC_026322
TCONS_00051338 lncRNA downstream 695683 23934882 ~ 24050083 (-) True XLOC_026322
TCONS_00053013 lncRNA downstream 695702 23701286 ~ 24050064 (-) False XLOC_026322
TCONS_00051335 lncRNA downstream 884825 23747574 ~ 23860941 (-) False XLOC_026322
TCONS_00051360 lncRNA upstream 386139 25132020 ~ 25135109 (-) True XLOC_026339
TCONS_00051366 lncRNA upstream 524838 25270719 ~ 25273434 (-) False XLOC_026342
TCONS_00051380 lncRNA upstream 937003 25682884 ~ 25699598 (-) False XLOC_026348
TCONS_00051379 lncRNA upstream 937003 25682884 ~ 25701218 (-) False XLOC_026348
TCONS_00053019 lncRNA upstream 945445 25691326 ~ 25699602 (-) False XLOC_026348
TCONS_00051347 mRNA downstream 64362 24675029 ~ 24681404 (-) True XLOC_026331
TCONS_00051346 mRNA downstream 287485 24448102 ~ 24458281 (-) True XLOC_026330
TCONS_00051344 mRNA downstream 289228 24437363 ~ 24456538 (-) False XLOC_026330
TCONS_00051345 mRNA downstream 289315 24438932 ~ 24456451 (-) False XLOC_026330
TCONS_00051341 mRNA downstream 407603 24314697 ~ 24338163 (-) False XLOC_026328
TCONS_00051349 mRNA upstream 48040 24793921 ~ 24909245 (-) True XLOC_026333
TCONS_00051350 mRNA upstream 227144 24973025 ~ 24980067 (-) True XLOC_026334
TCONS_00051351 mRNA upstream 251049 24996930 ~ 25055795 (-) False XLOC_026335
TCONS_00051352 mRNA upstream 252213 24998094 ~ 25054002 (-) True XLOC_026335
TCONS_00051353 mRNA upstream 313621 25059502 ~ 25086986 (-) False XLOC_026336
TCONS_00051343 other downstream 342497 24403149 ~ 24403269 (-) True XLOC_026329
TCONS_00051337 other downstream 927720 23817922 ~ 23818046 (-) True XLOC_026325
TCONS_00051315 other downstream 1310765 23430245 ~ 23435001 (-) True XLOC_026315
TCONS_00051313 other downstream 1363158 23382492 ~ 23382608 (-) True XLOC_026314
TCONS_00051290 other downstream 2568638 22161451 ~ 22177128 (-) False XLOC_026304
TCONS_00051354 other upstream 333568 25079449 ~ 25086951 (-) True XLOC_026336
TCONS_00051368 other upstream 528261 25274142 ~ 25275351 (-) True XLOC_026342
TCONS_00051408 other upstream 1917167 26663048 ~ 26663165 (-) True XLOC_026371
TCONS_00051423 other upstream 2319504 27065385 ~ 27066120 (-) True XLOC_026380
TCONS_00051424 other upstream 2337417 27083298 ~ 27083414 (-) True XLOC_026381