RNA id: TCONS_00051648



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00051648
length 186
lncRNA type antisense
GC content 0.34
exon number 2
gene id XLOC_026500
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 33344076 ~ 33345247 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AGTAATGTGAAGTTGCAGCAGGTTCAACAaagaatatatatttgtatgtatctTGTAAGATGCCCATCTAAACATTAGCTAAAAGTATATGCTAATGGTTAAGGTGGGAAAAATTCACGAGCTATTCCAGATTCTATTACCACACATCTAAACAAATCCATTTACTCCAATACCCGCTAAATCAGG

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000163387

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00051647 lncRNA downstream 39953 33300418 ~ 33304123 (-) True XLOC_026499
TCONS_00053064 lncRNA downstream 42765 33300194 ~ 33301311 (-) False XLOC_026499
TCONS_00051646 lncRNA downstream 84455 33083988 ~ 33259621 (-) True XLOC_026498
TCONS_00051645 lncRNA downstream 230393 33083988 ~ 33113683 (-) False XLOC_026498
TCONS_00051626 lncRNA downstream 418579 32924539 ~ 32925497 (-) False XLOC_026492
TCONS_00051651 lncRNA upstream 51458 33396705 ~ 33398537 (-) True XLOC_026502
TCONS_00051653 lncRNA upstream 74972 33420219 ~ 33422734 (-) True XLOC_026503
TCONS_00051655 lncRNA upstream 78777 33424024 ~ 33426932 (-) False XLOC_026504
TCONS_00051657 lncRNA upstream 80298 33425545 ~ 33427584 (-) True XLOC_026504
TCONS_00051659 lncRNA upstream 90507 33435754 ~ 33437732 (-) True XLOC_026506
TCONS_00051643 mRNA downstream 168493 33065613 ~ 33175583 (-) False XLOC_026498
TCONS_00051644 mRNA downstream 230197 33066004 ~ 33113879 (-) False XLOC_026498
TCONS_00051641 mRNA downstream 312277 33005024 ~ 33031799 (-) False XLOC_026497
TCONS_00051639 mRNA downstream 313349 32993447 ~ 33030727 (-) False XLOC_026497
TCONS_00051649 mRNA upstream 43776 33389023 ~ 33395233 (-) True XLOC_026501
TCONS_00051650 mRNA upstream 50695 33395942 ~ 33417826 (-) False XLOC_026502
TCONS_00051652 mRNA upstream 74967 33420214 ~ 33422738 (-) False XLOC_026503
TCONS_00051654 mRNA upstream 78739 33423986 ~ 33427803 (-) False XLOC_026504
TCONS_00051658 mRNA upstream 86944 33432191 ~ 33437796 (-) False XLOC_026506
TCONS_00051635 other downstream 370542 32972974 ~ 32973534 (-) True XLOC_026495
TCONS_00051585 other downstream 1156691 32186134 ~ 32187385 (-) False XLOC_026474
TCONS_00051529 other downstream 2543418 30800541 ~ 30800658 (-) True XLOC_026441
TCONS_00051520 other downstream 2855982 30454353 ~ 30488094 (-) False XLOC_026436
TCONS_00051482 other downstream 3473952 29868899 ~ 29870124 (-) True XLOC_026416
TCONS_00051656 other upstream 78945 33424192 ~ 33424328 (-) True XLOC_026505
TCONS_00051678 other upstream 603422 33948669 ~ 33948788 (-) True XLOC_026513
TCONS_00051702 other upstream 677918 34023165 ~ 34023613 (-) True XLOC_026529
TCONS_00051708 other upstream 689945 34035192 ~ 34035631 (-) True XLOC_026534
TCONS_00051712 other upstream 692234 34037481 ~ 34037881 (-) True XLOC_026535