RNA id: TCONS_00051859


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00051859
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_026621
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 37075698 ~ 37075813 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

actgccggcagctagctctatgcaactctcacatggtctcccactgaagctaagtagggctgcgcccggtcagtacctggattgaagaccacatgggaaagctaggtagCTCAGTA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000174908

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00053073 lncRNA downstream 103476 36969403 ~ 36972222 (-) True XLOC_026619
TCONS_00053072 lncRNA downstream 121610 36953625 ~ 36954088 (-) True XLOC_026617
TCONS_00052478 lncRNA downstream 464674 36610334 ~ 36611024 (-) True XLOC_026609
TCONS_00053071 lncRNA downstream 488562 36583100 ~ 36587136 (-) True XLOC_026606
TCONS_00051832 lncRNA downstream 618390 36451635 ~ 36457308 (-) True XLOC_026604
TCONS_00051861 lncRNA upstream 60605 37136418 ~ 37143881 (-) True XLOC_026622
TCONS_00053074 lncRNA upstream 505709 37581522 ~ 37584807 (-) True XLOC_026625
TCONS_00053075 lncRNA upstream 558287 37634100 ~ 37649261 (-) False XLOC_026626
TCONS_00051868 lncRNA upstream 558287 37634100 ~ 37649389 (-) False XLOC_026626
TCONS_00051869 lncRNA upstream 558873 37634686 ~ 37639858 (-) True XLOC_026626
TCONS_00051854 mRNA downstream 130949 36904041 ~ 36944749 (-) False XLOC_026616
TCONS_00051853 mRNA downstream 143183 36904039 ~ 36932515 (-) False XLOC_026616
TCONS_00051855 mRNA downstream 143183 36920472 ~ 36932515 (-) True XLOC_026616
TCONS_00051851 mRNA downstream 229202 36836711 ~ 36846496 (-) False XLOC_026615
TCONS_00051852 mRNA downstream 236583 36836719 ~ 36839115 (-) True XLOC_026615
TCONS_00051860 mRNA upstream 59703 37135516 ~ 37148594 (-) False XLOC_026622
TCONS_00051862 mRNA upstream 160111 37235924 ~ 37476475 (-) False XLOC_026623
TCONS_00051863 mRNA upstream 164154 37239967 ~ 37351225 (-) False XLOC_026623
TCONS_00051864 mRNA upstream 164154 37239967 ~ 37476278 (-) True XLOC_026623
TCONS_00051865 mRNA upstream 482678 37558491 ~ 37571601 (-) False XLOC_026624
TCONS_00051856 other downstream 107705 36967871 ~ 36967993 (-) True XLOC_026618
TCONS_00051846 other downstream 319549 36756033 ~ 36756149 (-) True XLOC_026612
TCONS_00051819 other downstream 828903 36241668 ~ 36246795 (-) True XLOC_026597
TCONS_00051818 other downstream 828976 36240312 ~ 36246722 (-) False XLOC_026597
TCONS_00051816 other downstream 836657 36234207 ~ 36239041 (-) False XLOC_026597
TCONS_00051873 other upstream 597835 37673648 ~ 37699951 (-) False XLOC_026627
TCONS_00051881 other upstream 691472 37767285 ~ 37773800 (-) False XLOC_026629
TCONS_00051892 other upstream 1837565 38913378 ~ 38918717 (-) False XLOC_026635
TCONS_00051900 other upstream 2162283 39238096 ~ 39259677 (-) False XLOC_026643
TCONS_00051909 other upstream 2573632 39649445 ~ 39649562 (-) True XLOC_026651

Expression Profile

//