RNA id: TCONS_00051909



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00051909
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_026651
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 39649445 ~ 39649562 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AACAGCCATACAAAACATtcccctgcagcccaagaccggttactcactgaagctaagcagggctgaccCTGGTCAGTTCTTGGACGGGAGACcatatgggaaaactaggttgctgttg

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118093

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00053080 lncRNA downstream 86144 39561784 ~ 39563301 (-) True XLOC_026648
TCONS_00051904 lncRNA downstream 194542 39371873 ~ 39454903 (-) True XLOC_026646
TCONS_00052480 lncRNA downstream 535898 39112314 ~ 39113547 (-) True XLOC_026637
TCONS_00053079 lncRNA downstream 673747 38974260 ~ 38975698 (-) True XLOC_026636
TCONS_00053078 lncRNA downstream 673831 38971435 ~ 38975614 (-) False XLOC_026636
TCONS_00051912 lncRNA upstream 42796 39692358 ~ 39696058 (-) True XLOC_026652
TCONS_00051913 lncRNA upstream 296303 39945865 ~ 39951527 (-) True XLOC_026653
TCONS_00053081 lncRNA upstream 530574 40180136 ~ 40181654 (-) True XLOC_026659
TCONS_00051928 lncRNA upstream 601854 40251416 ~ 40251945 (-) True XLOC_026662
TCONS_00053082 lncRNA upstream 746501 40396063 ~ 40405249 (-) False XLOC_026666
TCONS_00051908 mRNA downstream 1424 39630930 ~ 39648021 (-) True XLOC_026650
TCONS_00051907 mRNA downstream 22033 39619571 ~ 39627412 (-) True XLOC_026649
TCONS_00051905 mRNA downstream 160806 39472342 ~ 39488639 (-) False XLOC_026647
TCONS_00051906 mRNA downstream 160963 39473188 ~ 39488482 (-) True XLOC_026647
TCONS_00051903 mRNA downstream 286380 39313094 ~ 39363065 (-) True XLOC_026645
TCONS_00051910 mRNA upstream 41963 39691525 ~ 39696066 (-) False XLOC_026652
TCONS_00051911 mRNA upstream 42671 39692233 ~ 39695856 (-) False XLOC_026652
TCONS_00051915 mRNA upstream 320793 39970355 ~ 40051425 (-) False XLOC_026655
TCONS_00051916 mRNA upstream 325687 39975249 ~ 40054615 (-) False XLOC_026655
TCONS_00051917 mRNA upstream 350451 40000013 ~ 40054749 (-) False XLOC_026655
TCONS_00051900 other downstream 389768 39238096 ~ 39259677 (-) False XLOC_026643
TCONS_00051892 other downstream 730728 38913378 ~ 38918717 (-) False XLOC_026635
TCONS_00051881 other downstream 1875645 37767285 ~ 37773800 (-) False XLOC_026629
TCONS_00051873 other downstream 1949494 37673648 ~ 37699951 (-) False XLOC_026627
TCONS_00051859 other downstream 2573632 37075698 ~ 37075813 (-) True XLOC_026621
TCONS_00051914 other upstream 307796 39957358 ~ 39957474 (-) True XLOC_026654
TCONS_00051921 other upstream 439123 40088685 ~ 40088801 (-) True XLOC_026657
TCONS_00051924 other upstream 504732 40154294 ~ 40158687 (-) True XLOC_026658
TCONS_00051938 other upstream 877317 40526879 ~ 40529778 (-) False XLOC_026667
TCONS_00051939 other upstream 877320 40526882 ~ 40529779 (-) False XLOC_026667