RNA id: TCONS_00051964



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00051964
length 122
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_026680
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 41312022 ~ 41312143 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCTAATAGCCAGCAGCTTggtctctgcaactctcacatatctgctcactgaagctaaacagggctgcacctggtcagtacctggaaaGGAGACCACatagaaaagctaggttgctaaCGGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000161915

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00051957 lncRNA downstream 349190 40959578 ~ 40962832 (-) True XLOC_026677
TCONS_00053084 lncRNA downstream 534299 40774418 ~ 40777723 (-) True XLOC_026671
TCONS_00051941 lncRNA downstream 782246 40527285 ~ 40529776 (-) False XLOC_026667
TCONS_00051940 lncRNA downstream 782247 40527285 ~ 40529775 (-) False XLOC_026667
TCONS_00051942 lncRNA downstream 782247 40527468 ~ 40529775 (-) True XLOC_026667
TCONS_00051965 lncRNA upstream 83980 41396123 ~ 41512210 (-) False XLOC_026681
TCONS_00051966 lncRNA upstream 133051 41445194 ~ 41512210 (-) True XLOC_026681
TCONS_00051968 lncRNA upstream 219139 41531282 ~ 41535761 (-) True XLOC_026682
TCONS_00051975 lncRNA upstream 693077 42005220 ~ 42032476 (-) False XLOC_026685
TCONS_00053085 lncRNA upstream 871210 42183353 ~ 42189025 (-) False XLOC_026687
TCONS_00051963 mRNA downstream 19453 40980264 ~ 41292569 (-) True XLOC_026679
TCONS_00051962 mRNA downstream 19747 40978997 ~ 41292275 (-) False XLOC_026679
TCONS_00051958 mRNA downstream 335440 40969242 ~ 40976582 (-) False XLOC_026678
TCONS_00051961 mRNA downstream 335559 40975202 ~ 40976463 (-) True XLOC_026678
TCONS_00051959 mRNA downstream 335734 40969322 ~ 40976288 (-) False XLOC_026678
TCONS_00051967 mRNA upstream 219136 41531279 ~ 41535761 (-) False XLOC_026682
TCONS_00051969 mRNA upstream 317462 41629605 ~ 41715690 (-) True XLOC_026683
TCONS_00051970 mRNA upstream 472399 41784542 ~ 41795917 (-) False XLOC_026684
TCONS_00051971 mRNA upstream 473718 41785861 ~ 41791178 (-) True XLOC_026684
TCONS_00051972 mRNA upstream 643215 41955358 ~ 42086577 (-) False XLOC_026685
TCONS_00051939 other downstream 782243 40526882 ~ 40529779 (-) False XLOC_026667
TCONS_00051938 other downstream 782244 40526879 ~ 40529778 (-) False XLOC_026667
TCONS_00051924 other downstream 1153335 40154294 ~ 40158687 (-) True XLOC_026658
TCONS_00051921 other downstream 1223221 40088685 ~ 40088801 (-) True XLOC_026657
TCONS_00051914 other downstream 1354548 39957358 ~ 39957474 (-) True XLOC_026654
TCONS_00051981 other upstream 1553940 42866083 ~ 42866200 (-) True XLOC_026691
TCONS_00052007 other upstream 2769480 44081623 ~ 44094226 (-) False XLOC_026707
TCONS_00052055 other upstream 5882994 47195137 ~ 47195234 (-) True XLOC_026732
TCONS_00052070 other upstream 7765619 49077762 ~ 49077879 (-) True XLOC_026748
TCONS_00052082 other upstream 8503054 49815197 ~ 49815287 (-) False XLOC_026760