RNA id: TCONS_00051981


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00051981
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_026691
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 42866083 ~ 42866200 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCCAcaaccatatcaccctgcagccaaagacacggttactcactgaagctaagcagggctgagcccgatcagtacctggatgggagaccacataggaaagctaggttgctgtcgtaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000162019

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00052483 lncRNA downstream 119299 42548944 ~ 42746784 (-) False XLOC_026690
TCONS_00052484 lncRNA downstream 119299 42681982 ~ 42746784 (-) True XLOC_026690
TCONS_00052482 lncRNA downstream 492484 42371784 ~ 42373599 (-) False XLOC_026689
TCONS_00052481 lncRNA downstream 492484 42371784 ~ 42373599 (-) True XLOC_026689
TCONS_00051980 lncRNA downstream 650070 42212710 ~ 42216013 (-) True XLOC_026688
TCONS_00053097 lncRNA upstream 92868 42959068 ~ 42963234 (-) True XLOC_026692
TCONS_00053098 lncRNA upstream 158621 43024821 ~ 43026735 (-) True XLOC_026694
TCONS_00052485 lncRNA upstream 320994 43187194 ~ 43189085 (-) True XLOC_026695
TCONS_00053099 lncRNA upstream 713290 43579490 ~ 43582355 (-) False XLOC_026698
TCONS_00052486 lncRNA upstream 795492 43661692 ~ 43686469 (-) True XLOC_026698
TCONS_00051977 mRNA downstream 740428 42121166 ~ 42125655 (-) True XLOC_026686
TCONS_00051976 mRNA downstream 779435 42032360 ~ 42086648 (-) True XLOC_026685
TCONS_00051972 mRNA downstream 779506 41955358 ~ 42086577 (-) False XLOC_026685
TCONS_00051974 mRNA downstream 849390 41978867 ~ 42016693 (-) False XLOC_026685
TCONS_00051973 mRNA downstream 870762 41967804 ~ 41995321 (-) False XLOC_026685
TCONS_00051982 mRNA upstream 51943 42918143 ~ 42968544 (-) False XLOC_026692
TCONS_00051983 mRNA upstream 97845 42964045 ~ 42981739 (-) False XLOC_026693
TCONS_00051984 mRNA upstream 98516 42964716 ~ 42967698 (-) True XLOC_026693
TCONS_00051985 mRNA upstream 481317 43347517 ~ 43821191 (-) False XLOC_026696
TCONS_00051986 mRNA upstream 486356 43352556 ~ 43356082 (-) True XLOC_026697
TCONS_00051964 other downstream 1553940 41312022 ~ 41312143 (-) True XLOC_026680
TCONS_00051939 other downstream 2336304 40526882 ~ 40529779 (-) False XLOC_026667
TCONS_00051938 other downstream 2336305 40526879 ~ 40529778 (-) False XLOC_026667
TCONS_00051924 other downstream 2707396 40154294 ~ 40158687 (-) True XLOC_026658
TCONS_00051921 other downstream 2777282 40088685 ~ 40088801 (-) True XLOC_026657
TCONS_00052007 other upstream 1215423 44081623 ~ 44094226 (-) False XLOC_026707
TCONS_00052055 other upstream 4328937 47195137 ~ 47195234 (-) True XLOC_026732
TCONS_00052070 other upstream 6211562 49077762 ~ 49077879 (-) True XLOC_026748
TCONS_00052082 other upstream 6948997 49815197 ~ 49815287 (-) False XLOC_026760
TCONS_00052087 other upstream 7237871 50104071 ~ 50117962 (-) True XLOC_026764