RNA id: TCONS_00052254



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00052254
length 129
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_026892
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 60451500 ~ 60451628 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ttgagaaactgttctactgtgaTAACCCGCAGCTTGCTCTCACATGCtcgctcactgaagctaagcatggctgcgcctggtcagtacctggatgggagaacacatgggaaagctaggttgctgcctaCC

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000121068

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00053178 lncRNA downstream 323939 60126527 ~ 60127561 (-) True XLOC_026886
TCONS_00053177 lncRNA downstream 382549 60067382 ~ 60068951 (-) True XLOC_026885
TCONS_00053176 lncRNA downstream 382714 60067382 ~ 60068786 (-) False XLOC_026885
TCONS_00053174 lncRNA downstream 395741 60036101 ~ 60055759 (-) False XLOC_026884
TCONS_00053175 lncRNA downstream 395937 60042152 ~ 60055563 (-) True XLOC_026884
TCONS_00052509 lncRNA upstream 142507 60594135 ~ 60602432 (-) False XLOC_026895
TCONS_00053179 lncRNA upstream 405394 60857022 ~ 60861145 (-) True XLOC_026899
TCONS_00053180 lncRNA upstream 435257 60886885 ~ 60888183 (-) True XLOC_026900
TCONS_00053181 lncRNA upstream 497940 60949568 ~ 60956010 (-) False XLOC_026901
TCONS_00053182 lncRNA upstream 502766 60954394 ~ 60955985 (-) True XLOC_026901
TCONS_00052252 mRNA downstream 49674 60338988 ~ 60401826 (-) False XLOC_026891
TCONS_00052253 mRNA downstream 49674 60339062 ~ 60401826 (-) True XLOC_026891
TCONS_00052251 mRNA downstream 135382 60314274 ~ 60316118 (-) True XLOC_026890
TCONS_00052249 mRNA downstream 142563 60285668 ~ 60308937 (-) False XLOC_026889
TCONS_00052250 mRNA downstream 149699 60292588 ~ 60301801 (-) True XLOC_026889
TCONS_00052255 mRNA upstream 74354 60525982 ~ 60571218 (-) True XLOC_026893
TCONS_00052256 mRNA upstream 123485 60575113 ~ 60589292 (-) True XLOC_026894
TCONS_00052257 mRNA upstream 142510 60594138 ~ 60602432 (-) True XLOC_026895
TCONS_00052258 mRNA upstream 233281 60684909 ~ 60711127 (-) True XLOC_026896
TCONS_00052259 mRNA upstream 361223 60812851 ~ 60827402 (-) True XLOC_026897
TCONS_00052189 other downstream 3834459 56601900 ~ 56617041 (-) False XLOC_026836
TCONS_00052186 other downstream 3876535 56480812 ~ 56574965 (-) True XLOC_026833
TCONS_00052174 other downstream 4801083 55644209 ~ 55650417 (-) False XLOC_026829
TCONS_00052166 other downstream 4970343 55456353 ~ 55481157 (-) True XLOC_026827
TCONS_00052148 other downstream 5372256 55063267 ~ 55079244 (-) True XLOC_026816