RNA id: TCONS_00055299



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00055299
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_028494
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 7185195 ~ 7185311 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ttctacagccatatcaccctgcagcccaaaagcagttactcactgaagcttagcagggctgagcctggtcagtccCTGGGTGGGAGGCCACATGTGAAAACTAGGCTGCGGTCGGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176820

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00058046 lncRNA downstream 160898 7020450 ~ 7024297 (-) False XLOC_028493
TCONS_00057322 lncRNA downstream 161670 7020729 ~ 7023525 (-) False XLOC_028493
TCONS_00057321 lncRNA downstream 161670 7020729 ~ 7023525 (-) True XLOC_028493
TCONS_00055298 lncRNA downstream 379274 6805098 ~ 6805921 (-) True XLOC_028492
TCONS_00058044 lncRNA downstream 604648 6576777 ~ 6580547 (-) False XLOC_028491
TCONS_00058047 lncRNA upstream 352704 7538015 ~ 7546103 (-) False XLOC_028498
TCONS_00058048 lncRNA upstream 352704 7538015 ~ 7546117 (-) True XLOC_028498
TCONS_00057323 lncRNA upstream 372103 7557414 ~ 7566507 (-) True XLOC_028499
TCONS_00057324 lncRNA upstream 393550 7578861 ~ 7581433 (-) True XLOC_028500
TCONS_00057325 lncRNA upstream 412899 7598210 ~ 7631260 (-) False XLOC_028501
TCONS_00055296 mRNA downstream 375872 6799794 ~ 6809323 (-) False XLOC_028492
TCONS_00055297 mRNA downstream 378563 6805038 ~ 6806632 (-) False XLOC_028492
TCONS_00055291 mRNA downstream 561550 6423352 ~ 6623645 (-) False XLOC_028490
TCONS_00055290 mRNA downstream 617692 6423041 ~ 6567503 (-) False XLOC_028490
TCONS_00055292 mRNA downstream 617840 6423420 ~ 6567355 (-) False XLOC_028490
TCONS_00055300 mRNA upstream 25444 7210755 ~ 7212875 (-) True XLOC_028495
TCONS_00055302 mRNA upstream 43925 7229236 ~ 7231480 (-) True XLOC_028497
TCONS_00055304 mRNA upstream 468296 7653607 ~ 7673165 (-) False XLOC_028503
TCONS_00055307 mRNA upstream 533543 7718854 ~ 7811925 (-) True XLOC_028505
TCONS_00055308 mRNA upstream 665818 7851129 ~ 7869731 (-) True XLOC_028506
TCONS_00055295 other downstream 617929 6565653 ~ 6567266 (-) True XLOC_028490
TCONS_00055293 other downstream 733463 6436764 ~ 6451732 (-) False XLOC_028490
TCONS_00055263 other downstream 1813573 5370056 ~ 5371622 (-) True XLOC_028470
TCONS_00055239 other downstream 2252671 4930411 ~ 4932524 (-) True XLOC_028460
TCONS_00055225 other downstream 2614390 4546209 ~ 4570805 (-) True XLOC_028452
TCONS_00055301 other upstream 36769 7222080 ~ 7222367 (-) True XLOC_028496
TCONS_00055306 other upstream 494668 7679979 ~ 7680095 (-) True XLOC_028504
TCONS_00055310 other upstream 685354 7870665 ~ 7875944 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055311 other upstream 685425 7870736 ~ 7875760 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055313 other upstream 685584 7870895 ~ 7875930 (-) False XLOC_028507