RNA id: TCONS_00055306


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00055306
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_028504
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 7679979 ~ 7680095 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TTCCACAGCCACATCACCCTGCAgtccaagactggttactcactgaagctaagcagggctgagccttgtcagtacctggatgggagatcacatggggAAACTAagttgctgtcggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185163

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00055305 lncRNA downstream 6856 7666715 ~ 7673123 (-) True XLOC_028503
TCONS_00058050 lncRNA downstream 26790 7598400 ~ 7653189 (-) False XLOC_028501
TCONS_00058060 lncRNA downstream 26811 7650010 ~ 7653168 (-) True XLOC_028501
TCONS_00058051 lncRNA downstream 26858 7607656 ~ 7653121 (-) False XLOC_028501
TCONS_00058057 lncRNA downstream 26858 7626078 ~ 7653121 (-) False XLOC_028501
TCONS_00055314 lncRNA upstream 192226 7872321 ~ 7875551 (-) True XLOC_028507
TCONS_00058061 lncRNA upstream 291587 7971682 ~ 7973335 (-) True XLOC_028508
TCONS_00058062 lncRNA upstream 533075 8213170 ~ 8214435 (-) True XLOC_028516
TCONS_00057326 lncRNA upstream 539366 8219461 ~ 8219991 (-) True XLOC_028517
TCONS_00055330 lncRNA upstream 954609 8634704 ~ 8638629 (-) True XLOC_028520
TCONS_00055304 mRNA downstream 6814 7653607 ~ 7673165 (-) False XLOC_028503
TCONS_00055302 mRNA downstream 448499 7229236 ~ 7231480 (-) True XLOC_028497
TCONS_00055300 mRNA downstream 467104 7210755 ~ 7212875 (-) True XLOC_028495
TCONS_00055296 mRNA downstream 870656 6799794 ~ 6809323 (-) False XLOC_028492
TCONS_00055297 mRNA downstream 873347 6805038 ~ 6806632 (-) False XLOC_028492
TCONS_00055307 mRNA upstream 38759 7718854 ~ 7811925 (-) True XLOC_028505
TCONS_00055308 mRNA upstream 171034 7851129 ~ 7869731 (-) True XLOC_028506
TCONS_00055309 mRNA upstream 190289 7870384 ~ 7876005 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055312 mRNA upstream 190733 7870828 ~ 7875808 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055315 mRNA upstream 321779 8001874 ~ 8014463 (-) True XLOC_028509
TCONS_00055301 other downstream 457612 7222080 ~ 7222367 (-) True XLOC_028496
TCONS_00055299 other downstream 494668 7185195 ~ 7185311 (-) True XLOC_028494
TCONS_00055295 other downstream 1112713 6565653 ~ 6567266 (-) True XLOC_028490
TCONS_00055293 other downstream 1228247 6436764 ~ 6451732 (-) False XLOC_028490
TCONS_00055263 other downstream 2308357 5370056 ~ 5371622 (-) True XLOC_028470
TCONS_00055310 other upstream 190570 7870665 ~ 7875944 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055311 other upstream 190641 7870736 ~ 7875760 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055313 other upstream 190800 7870895 ~ 7875930 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055327 other upstream 461254 8141349 ~ 8141466 (-) True XLOC_028515
TCONS_00055328 other upstream 907692 8587787 ~ 8587908 (-) True XLOC_028518

Expression Profile

//