RNA id: TCONS_00055327


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00055327
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_028515
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 8141349 ~ 8141466 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CCTTACAGTCACATcactctgcagcccaagaccagttactcactgaaggtAAGCAAGGCTGAGCCTTGCcattacctggatgggagaccacatgggaaaagcTAGGTTTCTGTTTGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000115476

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00058061 lncRNA downstream 168014 7971682 ~ 7973335 (-) True XLOC_028508
TCONS_00055314 lncRNA downstream 265798 7872321 ~ 7875551 (-) True XLOC_028507
TCONS_00055305 lncRNA downstream 468226 7666715 ~ 7673123 (-) True XLOC_028503
TCONS_00058060 lncRNA downstream 488181 7650010 ~ 7653168 (-) True XLOC_028501
TCONS_00058058 lncRNA downstream 488351 7640406 ~ 7652998 (-) False XLOC_028501
TCONS_00058062 lncRNA upstream 71704 8213170 ~ 8214435 (-) True XLOC_028516
TCONS_00057326 lncRNA upstream 77995 8219461 ~ 8219991 (-) True XLOC_028517
TCONS_00055330 lncRNA upstream 493238 8634704 ~ 8638629 (-) True XLOC_028520
TCONS_00055331 lncRNA upstream 567616 8709082 ~ 8735591 (-) True XLOC_028521
TCONS_00058063 lncRNA upstream 762825 8904291 ~ 8905453 (-) True XLOC_028525
TCONS_00055326 mRNA downstream 47596 8087704 ~ 8093753 (-) True XLOC_028514
TCONS_00055325 mRNA downstream 80387 8049003 ~ 8060962 (-) False XLOC_028514
TCONS_00055323 mRNA downstream 83135 8048864 ~ 8058214 (-) False XLOC_028514
TCONS_00055319 mRNA downstream 97385 8042805 ~ 8043964 (-) False XLOC_028513
TCONS_00055320 mRNA downstream 97510 8043377 ~ 8043839 (-) True XLOC_028513
TCONS_00055329 mRNA upstream 468051 8609517 ~ 8611841 (-) True XLOC_028519
TCONS_00055332 mRNA upstream 597627 8739093 ~ 8779141 (-) False XLOC_028522
TCONS_00055333 mRNA upstream 602089 8743555 ~ 8779189 (-) True XLOC_028522
TCONS_00055334 mRNA upstream 638713 8780179 ~ 8795250 (-) True XLOC_028523
TCONS_00055335 mRNA upstream 708350 8849816 ~ 8882572 (-) False XLOC_028524
TCONS_00055310 other downstream 265405 7870665 ~ 7875944 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055313 other downstream 265419 7870895 ~ 7875930 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055311 other downstream 265589 7870736 ~ 7875760 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055306 other downstream 461254 7679979 ~ 7680095 (-) True XLOC_028504
TCONS_00055301 other downstream 918982 7222080 ~ 7222367 (-) True XLOC_028496
TCONS_00055328 other upstream 446321 8587787 ~ 8587908 (-) True XLOC_028518
TCONS_00055389 other upstream 2520095 10661561 ~ 10661677 (-) True XLOC_028553
TCONS_00055432 other upstream 3465292 11606758 ~ 11606855 (-) True XLOC_028574
TCONS_00055433 other upstream 3466730 11608196 ~ 11608283 (-) True XLOC_028575
TCONS_00055457 other upstream 4133648 12275114 ~ 12286066 (-) True XLOC_028592

Expression Profile

//