RNA id: TCONS_00055328


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00055328
length 122
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_028518
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 8587787 ~ 8587908 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gtcggcagctagctctctgcatctTGCCAACTGCACATGGTCCTCCACTGAAGCTAAGCGGGGCtgtgcccagtcagtacctgtataggagaccacatgggaaagctaggttgttgccgGAT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118940

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00057326 lncRNA downstream 367796 8219461 ~ 8219991 (-) True XLOC_028517
TCONS_00058062 lncRNA downstream 373352 8213170 ~ 8214435 (-) True XLOC_028516
TCONS_00058061 lncRNA downstream 614452 7971682 ~ 7973335 (-) True XLOC_028508
TCONS_00055314 lncRNA downstream 712236 7872321 ~ 7875551 (-) True XLOC_028507
TCONS_00055305 lncRNA downstream 914664 7666715 ~ 7673123 (-) True XLOC_028503
TCONS_00055330 lncRNA upstream 46796 8634704 ~ 8638629 (-) True XLOC_028520
TCONS_00055331 lncRNA upstream 121174 8709082 ~ 8735591 (-) True XLOC_028521
TCONS_00058063 lncRNA upstream 316383 8904291 ~ 8905453 (-) True XLOC_028525
TCONS_00058064 lncRNA upstream 319821 8907729 ~ 9008724 (-) False XLOC_028526
TCONS_00058065 lncRNA upstream 387209 8975117 ~ 9008778 (-) False XLOC_028526
TCONS_00055321 mRNA downstream 432216 8045564 ~ 8155571 (-) False XLOC_028514
TCONS_00055322 mRNA downstream 435041 8047291 ~ 8152746 (-) False XLOC_028514
TCONS_00055324 mRNA downstream 435041 8048916 ~ 8152746 (-) False XLOC_028514
TCONS_00055326 mRNA downstream 494034 8087704 ~ 8093753 (-) True XLOC_028514
TCONS_00055325 mRNA downstream 526825 8049003 ~ 8060962 (-) False XLOC_028514
TCONS_00055329 mRNA upstream 21609 8609517 ~ 8611841 (-) True XLOC_028519
TCONS_00055332 mRNA upstream 151185 8739093 ~ 8779141 (-) False XLOC_028522
TCONS_00055333 mRNA upstream 155647 8743555 ~ 8779189 (-) True XLOC_028522
TCONS_00055334 mRNA upstream 192271 8780179 ~ 8795250 (-) True XLOC_028523
TCONS_00055335 mRNA upstream 261908 8849816 ~ 8882572 (-) False XLOC_028524
TCONS_00055327 other downstream 446321 8141349 ~ 8141466 (-) True XLOC_028515
TCONS_00055310 other downstream 711843 7870665 ~ 7875944 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055313 other downstream 711857 7870895 ~ 7875930 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055311 other downstream 712027 7870736 ~ 7875760 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055306 other downstream 907692 7679979 ~ 7680095 (-) True XLOC_028504
TCONS_00055389 other upstream 2073653 10661561 ~ 10661677 (-) True XLOC_028553
TCONS_00055432 other upstream 3018850 11606758 ~ 11606855 (-) True XLOC_028574
TCONS_00055433 other upstream 3020288 11608196 ~ 11608283 (-) True XLOC_028575
TCONS_00055457 other upstream 3687206 12275114 ~ 12286066 (-) True XLOC_028592
TCONS_00055464 other upstream 3825511 12413419 ~ 12433016 (-) True XLOC_028596