RNA id: TCONS_00055389


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00055389
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_028553
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 10661561 ~ 10661677 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCCAcaagccatgtcaccctgcagcccaagaacgGTTActaactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccactagggaacactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176447

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00057327 lncRNA downstream 312949 10346738 ~ 10348612 (-) True XLOC_028551
TCONS_00058069 lncRNA downstream 752190 9906081 ~ 9909371 (-) False XLOC_028550
TCONS_00055387 lncRNA downstream 752190 9907869 ~ 9909371 (-) True XLOC_028550
TCONS_00055377 lncRNA downstream 839042 9819357 ~ 9822519 (-) True XLOC_028546
TCONS_00055375 lncRNA downstream 859914 9798053 ~ 9801647 (-) True XLOC_028545
TCONS_00058070 lncRNA upstream 87300 10748977 ~ 10752573 (-) False XLOC_028554
TCONS_00058072 lncRNA upstream 87300 10748977 ~ 10752722 (-) False XLOC_028554
TCONS_00058071 lncRNA upstream 87300 10748977 ~ 10752722 (-) False XLOC_028554
TCONS_00058074 lncRNA upstream 87300 10748977 ~ 10752752 (-) False XLOC_028554
TCONS_00058073 lncRNA upstream 87300 10748977 ~ 10752752 (-) False XLOC_028554
TCONS_00055388 mRNA downstream 62499 10574822 ~ 10599062 (-) True XLOC_028552
TCONS_00055386 mRNA downstream 752190 9901116 ~ 9909371 (-) False XLOC_028550
TCONS_00055385 mRNA downstream 769687 9880647 ~ 9891874 (-) True XLOC_028549
TCONS_00055382 mRNA downstream 793718 9851810 ~ 9867843 (-) False XLOC_028548
TCONS_00055381 mRNA downstream 793718 9851810 ~ 9867843 (-) False XLOC_028548
TCONS_00055398 mRNA upstream 149813 10811490 ~ 10826575 (-) False XLOC_028555
TCONS_00055399 mRNA upstream 151584 10813261 ~ 10835620 (-) False XLOC_028555
TCONS_00055400 mRNA upstream 152233 10813910 ~ 10826575 (-) True XLOC_028555
TCONS_00055401 mRNA upstream 264494 10926171 ~ 10931729 (-) True XLOC_028557
TCONS_00055402 mRNA upstream 287712 10949389 ~ 10958074 (-) True XLOC_028558
TCONS_00055328 other downstream 2073653 8587787 ~ 8587908 (-) True XLOC_028518
TCONS_00055327 other downstream 2520095 8141349 ~ 8141466 (-) True XLOC_028515
TCONS_00055310 other downstream 2785617 7870665 ~ 7875944 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055313 other downstream 2785631 7870895 ~ 7875930 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055311 other downstream 2785801 7870736 ~ 7875760 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055432 other upstream 945081 11606758 ~ 11606855 (-) True XLOC_028574
TCONS_00055433 other upstream 946519 11608196 ~ 11608283 (-) True XLOC_028575
TCONS_00055457 other upstream 1613437 12275114 ~ 12286066 (-) True XLOC_028592
TCONS_00055464 other upstream 1751742 12413419 ~ 12433016 (-) True XLOC_028596
TCONS_00055465 other upstream 1934003 12595680 ~ 12595804 (-) True XLOC_028597