RNA id: TCONS_00058100


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00058100
length 18622
lncRNA type sense_over
GC content 0.33
exon number 1
gene id XLOC_028555
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 10766014 ~ 10835620 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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TCONS_00055415 lncRNA upstream 312326 11124613 ~ 11125166 (-) False XLOC_028568
TCONS_00055416 lncRNA upstream 312326 11124613 ~ 11125650 (-) False XLOC_028568
TCONS_00055421 lncRNA upstream 367222 11179509 ~ 11186936 (-) True XLOC_028570
TCONS_00055422 lncRNA upstream 433045 11245332 ~ 11248285 (-) True XLOC_028571
TCONS_00055426 lncRNA upstream 590404 11402691 ~ 11404177 (-) True XLOC_028572
TCONS_00055388 mRNA downstream 194604 10574822 ~ 10599062 (-) True XLOC_028552
TCONS_00055386 mRNA downstream 884295 9901116 ~ 9909371 (-) False XLOC_028550
TCONS_00055385 mRNA downstream 901792 9880647 ~ 9891874 (-) True XLOC_028549
TCONS_00055383 mRNA downstream 925881 9854075 ~ 9867785 (-) False XLOC_028548
TCONS_00055399 mRNA upstream 974 10813261 ~ 10835620 (-) False XLOC_028555
TCONS_00055400 mRNA upstream 1623 10813910 ~ 10826575 (-) True XLOC_028555
TCONS_00055401 mRNA upstream 113884 10926171 ~ 10931729 (-) True XLOC_028557
TCONS_00055402 mRNA upstream 137102 10949389 ~ 10958074 (-) True XLOC_028558
TCONS_00055403 mRNA upstream 147155 10959442 ~ 10973413 (-) False XLOC_028559
TCONS_00055389 other downstream 131989 10661561 ~ 10661677 (-) True XLOC_028553
TCONS_00055328 other downstream 2205758 8587787 ~ 8587908 (-) True XLOC_028518
TCONS_00055327 other downstream 2652200 8141349 ~ 8141466 (-) True XLOC_028515
TCONS_00055313 other downstream 2917736 7870895 ~ 7875930 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055311 other downstream 2917906 7870736 ~ 7875760 (-) False XLOC_028507
TCONS_00055432 other upstream 794471 11606758 ~ 11606855 (-) True XLOC_028574
TCONS_00055433 other upstream 795909 11608196 ~ 11608283 (-) True XLOC_028575
TCONS_00055457 other upstream 1462827 12275114 ~ 12286066 (-) True XLOC_028592
TCONS_00055464 other upstream 1601132 12413419 ~ 12433016 (-) True XLOC_028596
TCONS_00055465 other upstream 1783393 12595680 ~ 12595804 (-) True XLOC_028597

Expression Profile

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