RNA id: TCONS_00058103


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00058103
length 81482
lncRNA type antisense_over
GC content 0.38
exon number 1
gene id XLOC_028576
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 11610718 ~ 11692199 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO: NA

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JBrowse2

Neighbor

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TCONS_00055328 other downstream 3022810 8587787 ~ 8587908 (-) True XLOC_028518
TCONS_00055327 other downstream 3469252 8141349 ~ 8141466 (-) True XLOC_028515
TCONS_00055457 other upstream 582915 12275114 ~ 12286066 (-) True XLOC_028592
TCONS_00055464 other upstream 721220 12413419 ~ 12433016 (-) True XLOC_028596
TCONS_00055465 other upstream 903481 12595680 ~ 12595804 (-) True XLOC_028597
TCONS_00055473 other upstream 1085510 12777709 ~ 12781135 (-) True XLOC_028602
TCONS_00055491 other upstream 1214782 12906981 ~ 12914170 (-) True XLOC_028606

Expression Profile

//

Homologous

species RNA id representative length rna type GC content exon number chromosome id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000020_05569133_05573180.mRNA True 1641 mRNA 0.41 2 CI01000020 5568383 ~ 5573807 (+)
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) TU118977 True 491 lncRNA 0.28 3 NC_048566.1 1931271 ~ 1932179 (-)
striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) TU118977 True 735 lncRNA 0.44 1 NC_047600.1 16822368 ~ 16823102 (+)