RNA id: TCONS_00055683


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00055683
length 94
RNA type miRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_028719
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 18653148 ~ 18653241 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TCGGACAGGGTGAGGTAGTAGGTTGTGTGGTTTCAGGGTTGTGTTTTTGCCCCATCAGGAGTTAACTATACAACCTACTGCCTTCCCTGAAGGG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117021

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00055681 lncRNA downstream 46581 18605935 ~ 18606567 (-) True XLOC_028717
TCONS_00058187 lncRNA downstream 770218 17875071 ~ 17882930 (-) True XLOC_028707
TCONS_00058186 lncRNA downstream 770271 17875071 ~ 17882877 (-) False XLOC_028707
TCONS_00058185 lncRNA downstream 770529 17875071 ~ 17882619 (-) False XLOC_028707
TCONS_00058184 lncRNA downstream 770651 17875071 ~ 17882497 (-) False XLOC_028707
TCONS_00057349 lncRNA upstream 1441 18654682 ~ 18679692 (-) True XLOC_028721
TCONS_00058188 lncRNA upstream 59522 18712763 ~ 18714926 (-) True XLOC_028722
TCONS_00058189 lncRNA upstream 299241 18952482 ~ 18954075 (-) False XLOC_028727
TCONS_00058190 lncRNA upstream 299241 18952482 ~ 18964897 (-) False XLOC_028727
TCONS_00058191 lncRNA upstream 299241 18952482 ~ 18965119 (-) False XLOC_028727
TCONS_00055682 mRNA downstream 18143 18609539 ~ 18635005 (-) True XLOC_028718
TCONS_00055677 mRNA downstream 46575 18597665 ~ 18606573 (-) False XLOC_028717
TCONS_00055679 mRNA downstream 46575 18599556 ~ 18606573 (-) False XLOC_028717
TCONS_00055680 mRNA downstream 46617 18603010 ~ 18606531 (-) False XLOC_028717
TCONS_00055675 mRNA downstream 46624 18597162 ~ 18606524 (-) False XLOC_028717
TCONS_00055685 mRNA upstream 67544 18720785 ~ 18742106 (-) False XLOC_028723
TCONS_00055686 mRNA upstream 72807 18726048 ~ 18741942 (-) True XLOC_028723
TCONS_00055687 mRNA upstream 106048 18759289 ~ 18775548 (-) True XLOC_028724
TCONS_00055688 mRNA upstream 183550 18836791 ~ 18840919 (-) False XLOC_028725
TCONS_00055689 mRNA upstream 183554 18836795 ~ 18840487 (-) False XLOC_028725
TCONS_00055676 other downstream 46610 18597660 ~ 18606538 (-) False XLOC_028717
TCONS_00055674 other downstream 58008 18593830 ~ 18595140 (-) True XLOC_028716
TCONS_00055660 other downstream 463628 18189406 ~ 18189520 (-) True XLOC_028709
TCONS_00055659 other downstream 564142 18035497 ~ 18089006 (-) True XLOC_028708
TCONS_00055658 other downstream 614601 17999517 ~ 18038547 (-) False XLOC_028708
TCONS_00055684 other upstream 914 18654155 ~ 18654261 (-) True XLOC_028720
TCONS_00055699 other upstream 394225 19047466 ~ 19047555 (-) True XLOC_028730
TCONS_00055714 other upstream 1396083 20049324 ~ 20063234 (-) True XLOC_028742
TCONS_00055724 other upstream 1522902 20176143 ~ 20177868 (-) False XLOC_028749
TCONS_00055737 other upstream 1742808 20396049 ~ 20396170 (-) True XLOC_028756