RNA id: TCONS_00055773


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00055773
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_028779
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 23226733 ~ 23226849 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TCAAGACGCTATCACTTTGCTgttctcacatggttgcccactaaagctaagcagtgTTGAGCCTGGTCAGTgtctggataggagaccacatgggaaaataCGAGGCTGCTGCTGGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178695

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00057352 lncRNA downstream 16492 23204622 ~ 23210241 (-) True XLOC_028778
TCONS_00058206 lncRNA downstream 16686 23160015 ~ 23210047 (-) False XLOC_028778
TCONS_00058205 lncRNA downstream 101093 23119419 ~ 23125640 (-) True XLOC_028777
TCONS_00055772 lncRNA downstream 103223 23119419 ~ 23123510 (-) False XLOC_028777
TCONS_00058204 lncRNA downstream 934980 22282725 ~ 22291753 (-) True XLOC_028768
TCONS_00057353 lncRNA upstream 541629 23768478 ~ 23771489 (-) False XLOC_028784
TCONS_00058207 lncRNA upstream 1026917 24253766 ~ 24269283 (-) False XLOC_028786
TCONS_00058208 lncRNA upstream 1026917 24253766 ~ 24309850 (-) False XLOC_028786
TCONS_00058209 lncRNA upstream 1026917 24253766 ~ 24376025 (-) True XLOC_028786
TCONS_00058210 lncRNA upstream 1274280 24501129 ~ 24618981 (-) False XLOC_028787
TCONS_00055770 mRNA downstream 143546 22755465 ~ 23083187 (-) False XLOC_028776
TCONS_00055771 mRNA downstream 143748 22758918 ~ 23082985 (-) True XLOC_028776
TCONS_00055769 mRNA downstream 477180 22730795 ~ 22749553 (-) True XLOC_028775
TCONS_00055768 mRNA downstream 555264 22658472 ~ 22671469 (-) True XLOC_028774
TCONS_00055764 mRNA downstream 707208 22484830 ~ 22519525 (-) False XLOC_028773
TCONS_00055775 mRNA upstream 213555 23440404 ~ 23643272 (-) False XLOC_028781
TCONS_00055777 mRNA upstream 228749 23455598 ~ 23643272 (-) True XLOC_028781
TCONS_00055778 mRNA upstream 513806 23740655 ~ 23759192 (-) False XLOC_028783
TCONS_00055779 mRNA upstream 516827 23743676 ~ 23759213 (-) False XLOC_028783
TCONS_00055781 mRNA upstream 544185 23771034 ~ 23858900 (-) False XLOC_028784
TCONS_00055755 other downstream 989439 22236358 ~ 22237294 (-) True XLOC_028767
TCONS_00055751 other downstream 1574101 21651671 ~ 21652632 (-) True XLOC_028763
TCONS_00055737 other downstream 2830563 20396049 ~ 20396170 (-) True XLOC_028756
TCONS_00055724 other downstream 3048865 20176143 ~ 20177868 (-) False XLOC_028749
TCONS_00055714 other downstream 3163499 20049324 ~ 20063234 (-) True XLOC_028742
TCONS_00055774 other upstream 192471 23419320 ~ 23419455 (-) True XLOC_028780
TCONS_00055776 other upstream 224968 23451817 ~ 23451931 (-) True XLOC_028782
TCONS_00055780 other upstream 519194 23746043 ~ 23754271 (-) True XLOC_028783
TCONS_00055802 other upstream 2247357 25474206 ~ 25478995 (-) False XLOC_028796
TCONS_00055813 other upstream 2613937 25840786 ~ 25840902 (-) True XLOC_028802