RNA id: TCONS_00055774


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00055774
length 136
RNA type rRNA
GC content 0.45
exon number 1
gene id XLOC_028780
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 23419320 ~ 23419455 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tgccacagccatatcactctgAAGCCCAAGACTATTCTACACAAAACTATATGGTTATTtactgaaactaagcagggctgagcctggtcagtacctggattggagaccacaCGGGAAAACTAAGCTGGTGTTGATA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119443

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00057352 lncRNA downstream 209079 23204622 ~ 23210241 (-) True XLOC_028778
TCONS_00058206 lncRNA downstream 209273 23160015 ~ 23210047 (-) False XLOC_028778
TCONS_00058205 lncRNA downstream 293680 23119419 ~ 23125640 (-) True XLOC_028777
TCONS_00055772 lncRNA downstream 295810 23119419 ~ 23123510 (-) False XLOC_028777
TCONS_00058204 lncRNA downstream 1127567 22282725 ~ 22291753 (-) True XLOC_028768
TCONS_00057353 lncRNA upstream 349023 23768478 ~ 23771489 (-) False XLOC_028784
TCONS_00058207 lncRNA upstream 834311 24253766 ~ 24269283 (-) False XLOC_028786
TCONS_00058208 lncRNA upstream 834311 24253766 ~ 24309850 (-) False XLOC_028786
TCONS_00058209 lncRNA upstream 834311 24253766 ~ 24376025 (-) True XLOC_028786
TCONS_00058210 lncRNA upstream 1081674 24501129 ~ 24618981 (-) False XLOC_028787
TCONS_00055770 mRNA downstream 336133 22755465 ~ 23083187 (-) False XLOC_028776
TCONS_00055771 mRNA downstream 336335 22758918 ~ 23082985 (-) True XLOC_028776
TCONS_00055769 mRNA downstream 669767 22730795 ~ 22749553 (-) True XLOC_028775
TCONS_00055768 mRNA downstream 747851 22658472 ~ 22671469 (-) True XLOC_028774
TCONS_00055766 mRNA downstream 899795 22492355 ~ 22519525 (-) False XLOC_028773
TCONS_00055775 mRNA upstream 20949 23440404 ~ 23643272 (-) False XLOC_028781
TCONS_00055777 mRNA upstream 36143 23455598 ~ 23643272 (-) True XLOC_028781
TCONS_00055778 mRNA upstream 321200 23740655 ~ 23759192 (-) False XLOC_028783
TCONS_00055779 mRNA upstream 324221 23743676 ~ 23759213 (-) False XLOC_028783
TCONS_00055781 mRNA upstream 351579 23771034 ~ 23858900 (-) False XLOC_028784
TCONS_00055773 other downstream 192471 23226733 ~ 23226849 (-) True XLOC_028779
TCONS_00055755 other downstream 1182026 22236358 ~ 22237294 (-) True XLOC_028767
TCONS_00055751 other downstream 1766688 21651671 ~ 21652632 (-) True XLOC_028763
TCONS_00055737 other downstream 3023150 20396049 ~ 20396170 (-) True XLOC_028756
TCONS_00055724 other downstream 3241452 20176143 ~ 20177868 (-) False XLOC_028749
TCONS_00055776 other upstream 32362 23451817 ~ 23451931 (-) True XLOC_028782
TCONS_00055780 other upstream 326588 23746043 ~ 23754271 (-) True XLOC_028783
TCONS_00055802 other upstream 2054751 25474206 ~ 25478995 (-) False XLOC_028796
TCONS_00055813 other upstream 2421331 25840786 ~ 25840902 (-) True XLOC_028802
TCONS_00055827 other upstream 2987691 26407146 ~ 26407263 (-) True XLOC_028811