RNA id: TCONS_00055850


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00055850
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_028825
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 28542021 ~ 28542135 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gctggcagctagctctctgcgactctcacatggttgcccactgaagctaagaagAGCTGAGCccggtcagtacttggatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgtcggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178343

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00058220 lncRNA downstream 1702413 26839078 ~ 26839608 (-) True XLOC_028814
TCONS_00058219 lncRNA downstream 1776211 26752348 ~ 26765810 (-) True XLOC_028813
TCONS_00057358 lncRNA downstream 2119794 26417507 ~ 26422227 (-) True XLOC_028812
TCONS_00057357 lncRNA downstream 2289900 26250874 ~ 26252121 (-) True XLOC_028808
TCONS_00055823 lncRNA downstream 2394471 26127177 ~ 26147550 (-) True XLOC_028807
TCONS_00058221 lncRNA upstream 82734 28624869 ~ 28627715 (-) False XLOC_028826
TCONS_00057359 lncRNA upstream 82734 28624869 ~ 28628533 (-) False XLOC_028826
TCONS_00058222 lncRNA upstream 82734 28624869 ~ 28632583 (-) True XLOC_028826
TCONS_00058223 lncRNA upstream 177094 28719229 ~ 28720774 (-) False XLOC_028827
TCONS_00058224 lncRNA upstream 177094 28719229 ~ 28728040 (-) True XLOC_028827
TCONS_00055848 mRNA downstream 166894 28372166 ~ 28375127 (-) True XLOC_028823
TCONS_00055847 mRNA downstream 168112 28371732 ~ 28373909 (-) False XLOC_028823
TCONS_00055846 mRNA downstream 188483 28338642 ~ 28353538 (-) True XLOC_028822
TCONS_00055843 mRNA downstream 206837 28190013 ~ 28335184 (-) False XLOC_028821
TCONS_00055852 mRNA upstream 409423 28951558 ~ 28958601 (-) True XLOC_028830
TCONS_00055853 mRNA upstream 490508 29032643 ~ 29050583 (-) False XLOC_028831
TCONS_00055855 mRNA upstream 495673 29037808 ~ 29050583 (-) False XLOC_028831
TCONS_00055854 mRNA upstream 495673 29037808 ~ 29050583 (-) False XLOC_028831
TCONS_00055856 mRNA upstream 499124 29041259 ~ 29050235 (-) True XLOC_028831
TCONS_00055849 other downstream 109576 28432331 ~ 28432445 (-) True XLOC_028824
TCONS_00055832 other downstream 1400718 27141179 ~ 27141303 (-) True XLOC_028817
TCONS_00055829 other downstream 1442736 27088371 ~ 27099285 (-) True XLOC_028815
TCONS_00055827 other downstream 2134758 26407146 ~ 26407263 (-) True XLOC_028811
TCONS_00055813 other downstream 2701119 25840786 ~ 25840902 (-) True XLOC_028802
TCONS_00055851 other upstream 287759 28829894 ~ 28855677 (-) False XLOC_028829
TCONS_00055888 other upstream 2413206 30955341 ~ 30955504 (-) True XLOC_028861
TCONS_00055889 other upstream 2432781 30974916 ~ 30975079 (-) True XLOC_028862
TCONS_00055890 other upstream 2443221 30985356 ~ 30985519 (-) True XLOC_028863
TCONS_00055891 other upstream 2449746 30991881 ~ 30992044 (-) True XLOC_028864