RNA id: TCONS_00055991


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00055991
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_028931
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 35233297 ~ 35233413 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GataacagccatatcacactgcagcCCAAGACAGGTTACtccctgaagctaagcagggctgagcctggccagTGCCTGGCTGTGAGACCACtagggaaaactaggttgctgttagaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000180425

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00057375 lncRNA downstream 150014 35060147 ~ 35083283 (-) True XLOC_028930
TCONS_00057374 lncRNA downstream 179947 35052439 ~ 35053350 (-) True XLOC_028929
TCONS_00058261 lncRNA downstream 376167 34847760 ~ 34857130 (-) False XLOC_028928
TCONS_00058260 lncRNA downstream 376167 34847760 ~ 34857130 (-) False XLOC_028928
TCONS_00055990 lncRNA downstream 376167 34853066 ~ 34857130 (-) True XLOC_028928
TCONS_00057376 lncRNA upstream 257564 35490977 ~ 35493387 (-) False XLOC_028932
TCONS_00057377 lncRNA upstream 257564 35490977 ~ 35493425 (-) True XLOC_028932
TCONS_00057378 lncRNA upstream 458382 35691795 ~ 35692409 (-) True XLOC_028933
TCONS_00058262 lncRNA upstream 576040 35809453 ~ 35810787 (-) False XLOC_028935
TCONS_00058263 lncRNA upstream 576040 35809453 ~ 35811238 (-) True XLOC_028935
TCONS_00055989 mRNA downstream 433902 34798625 ~ 34799395 (-) True XLOC_028927
TCONS_00055987 mRNA downstream 457150 34753619 ~ 34776147 (-) False XLOC_028926
TCONS_00055988 mRNA downstream 457535 34753927 ~ 34775762 (-) True XLOC_028926
TCONS_00055984 mRNA downstream 752686 34449366 ~ 34480611 (-) False XLOC_028922
TCONS_00055985 mRNA downstream 752698 34468977 ~ 34480599 (-) True XLOC_028922
TCONS_00055993 mRNA upstream 617676 35851089 ~ 35899188 (-) False XLOC_028936
TCONS_00055994 mRNA upstream 659447 35892860 ~ 35900331 (-) False XLOC_028936
TCONS_00055995 mRNA upstream 659834 35893247 ~ 35989274 (-) False XLOC_028936
TCONS_00055996 mRNA upstream 715400 35948813 ~ 35963515 (-) False XLOC_028937
TCONS_00055997 mRNA upstream 726607 35960020 ~ 36026650 (-) False XLOC_028937
TCONS_00055986 other downstream 644210 34553067 ~ 34589087 (-) False XLOC_028925
TCONS_00055976 other downstream 1264945 33968210 ~ 33968352 (-) True XLOC_028919
TCONS_00055975 other downstream 1266229 33966917 ~ 33967068 (-) True XLOC_028918
TCONS_00055967 other downstream 1841376 33391775 ~ 33391921 (-) True XLOC_028910
TCONS_00055966 other downstream 1842913 33390222 ~ 33390384 (-) True XLOC_028909
TCONS_00055992 other upstream 501593 35735006 ~ 35735169 (-) True XLOC_028934
TCONS_00056013 other upstream 1555724 36789137 ~ 36789707 (-) False XLOC_028946
TCONS_00056015 other upstream 1556766 36790179 ~ 36790965 (-) True XLOC_028946
TCONS_00056020 other upstream 2033797 37267210 ~ 37271230 (-) False XLOC_028950
TCONS_00056021 other upstream 2035154 37268567 ~ 37270590 (-) False XLOC_028950