RNA id: TCONS_00055992



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00055992
length 164
RNA type snRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_028934
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 35735006 ~ 35735169 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


atacttacctggcaggggagataccatgatcaagaaggttgttcacccagggcgaggcttggccattgcactctgGCCAAGCTGACCACTgtgaattccccaaatgtgggaatctcgactgcataatttctggtagtgggggactgcgttcgcgctttcccctg

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000180489

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00057378 lncRNA downstream 42597 35691795 ~ 35692409 (-) True XLOC_028933
TCONS_00057377 lncRNA downstream 241581 35490977 ~ 35493425 (-) True XLOC_028932
TCONS_00057376 lncRNA downstream 241619 35490977 ~ 35493387 (-) False XLOC_028932
TCONS_00057375 lncRNA downstream 651723 35060147 ~ 35083283 (-) True XLOC_028930
TCONS_00057374 lncRNA downstream 681656 35052439 ~ 35053350 (-) True XLOC_028929
TCONS_00058262 lncRNA upstream 74284 35809453 ~ 35810787 (-) False XLOC_028935
TCONS_00058263 lncRNA upstream 74284 35809453 ~ 35811238 (-) True XLOC_028935
TCONS_00058264 lncRNA upstream 759789 36494958 ~ 36496294 (-) True XLOC_028941
TCONS_00057379 lncRNA upstream 846034 36581203 ~ 36583368 (-) True XLOC_028943
TCONS_00058265 lncRNA upstream 850150 36585319 ~ 36585639 (-) True XLOC_028944
TCONS_00055989 mRNA downstream 935611 34798625 ~ 34799395 (-) True XLOC_028927
TCONS_00055987 mRNA downstream 958859 34753619 ~ 34776147 (-) False XLOC_028926
TCONS_00055988 mRNA downstream 959244 34753927 ~ 34775762 (-) True XLOC_028926
TCONS_00055984 mRNA downstream 1254395 34449366 ~ 34480611 (-) False XLOC_028922
TCONS_00055993 mRNA upstream 115920 35851089 ~ 35899188 (-) False XLOC_028936
TCONS_00055994 mRNA upstream 157691 35892860 ~ 35900331 (-) False XLOC_028936
TCONS_00055995 mRNA upstream 158078 35893247 ~ 35989274 (-) False XLOC_028936
TCONS_00055996 mRNA upstream 213644 35948813 ~ 35963515 (-) False XLOC_028937
TCONS_00055997 mRNA upstream 224851 35960020 ~ 36026650 (-) False XLOC_028937
TCONS_00055991 other downstream 501593 35233297 ~ 35233413 (-) True XLOC_028931
TCONS_00055986 other downstream 1145919 34553067 ~ 34589087 (-) False XLOC_028925
TCONS_00055976 other downstream 1766654 33968210 ~ 33968352 (-) True XLOC_028919
TCONS_00055975 other downstream 1767938 33966917 ~ 33967068 (-) True XLOC_028918
TCONS_00055967 other downstream 2343085 33391775 ~ 33391921 (-) True XLOC_028910
TCONS_00056013 other upstream 1053968 36789137 ~ 36789707 (-) False XLOC_028946
TCONS_00056015 other upstream 1055010 36790179 ~ 36790965 (-) True XLOC_028946
TCONS_00056020 other upstream 1532041 37267210 ~ 37271230 (-) False XLOC_028950
TCONS_00056021 other upstream 1533398 37268567 ~ 37270590 (-) False XLOC_028950
TCONS_00056022 other upstream 1533493 37268662 ~ 37271042 (-) True XLOC_028950

Expression Profile


//