RNA id: TCONS_00056038


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00056038
length 107
RNA type snRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_028970
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 38233633 ~ 38233739 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gtgcttgctacggtggcacatatactaaaattggatcgatacagagaagattagcatggcccctgcgaaaggatgacacgcaaatccgtgaagcgctccatattgct

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000186760

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00057388 lncRNA downstream 73769 38158339 ~ 38159864 (-) False XLOC_028968
TCONS_00057387 lncRNA downstream 73769 38158339 ~ 38159864 (-) True XLOC_028968
TCONS_00057386 lncRNA downstream 85706 38146996 ~ 38147927 (-) False XLOC_028967
TCONS_00057385 lncRNA downstream 85706 38146996 ~ 38147927 (-) True XLOC_028967
TCONS_00058270 lncRNA downstream 450158 37779856 ~ 37783475 (-) True XLOC_028962
TCONS_00056053 lncRNA upstream 330825 38564564 ~ 38573606 (-) True XLOC_028979
TCONS_00058271 lncRNA upstream 679794 38913533 ~ 38916444 (-) True XLOC_028983
TCONS_00056064 lncRNA upstream 929375 39163114 ~ 39165255 (-) False XLOC_028985
TCONS_00058272 lncRNA upstream 1031240 39264979 ~ 39268051 (-) True XLOC_028986
TCONS_00058273 lncRNA upstream 1076046 39309785 ~ 39310683 (-) True XLOC_028987
TCONS_00056035 mRNA downstream 199833 38032613 ~ 38033800 (-) True XLOC_028965
TCONS_00056032 mRNA downstream 467459 37760928 ~ 37766174 (-) True XLOC_028961
TCONS_00056028 mRNA downstream 524972 37701476 ~ 37708661 (-) False XLOC_028958
TCONS_00056029 mRNA downstream 525824 37701892 ~ 37707809 (-) True XLOC_028958
TCONS_00056027 mRNA downstream 540096 37676326 ~ 37693537 (-) False XLOC_028957
TCONS_00056042 mRNA upstream 20960 38254699 ~ 38259998 (-) True XLOC_028974
TCONS_00056043 mRNA upstream 32131 38265870 ~ 38308760 (-) False XLOC_028975
TCONS_00056044 mRNA upstream 33542 38267281 ~ 38281909 (-) False XLOC_028975
TCONS_00056045 mRNA upstream 53611 38287350 ~ 38315895 (-) True XLOC_028975
TCONS_00056046 mRNA upstream 101796 38335535 ~ 38519671 (-) False XLOC_028976
TCONS_00056037 other downstream 1481 38232079 ~ 38232152 (-) True XLOC_028969
TCONS_00056036 other downstream 196728 38035942 ~ 38036905 (-) True XLOC_028966
TCONS_00056034 other downstream 210457 38023028 ~ 38023176 (-) True XLOC_028964
TCONS_00056033 other downstream 211996 38021474 ~ 38021637 (-) True XLOC_028963
TCONS_00056031 other downstream 502056 37731429 ~ 37731577 (-) True XLOC_028960
TCONS_00056039 other upstream 421 38234160 ~ 38234266 (-) True XLOC_028971
TCONS_00056040 other upstream 3378 38237117 ~ 38237190 (-) True XLOC_028972
TCONS_00056041 other upstream 3865 38237604 ~ 38237704 (-) True XLOC_028973
TCONS_00056047 other upstream 101813 38335552 ~ 38347220 (-) False XLOC_028976
TCONS_00056067 other upstream 1123927 39357666 ~ 39357785 (-) True XLOC_028988