RNA id: TCONS_00005331



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00005331
length 85
RNA type miRNA
GC content 0.42
exon number 1
gene id XLOC_002885
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 33377130 ~ 33377214 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGTCTGTCCAGTGCCCCTTTTATATTGTACTACTGATAACCCAGTTATTAAAGCAGTGCAATGTTAAAAGGGCATTGGCCAGGGA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118778

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00006084 lncRNA downstream 212557 33158589 ~ 33164573 (-) True XLOC_002877
TCONS_00006083 lncRNA downstream 480186 32894997 ~ 32896944 (-) True XLOC_002875
TCONS_00006082 lncRNA downstream 596840 32779880 ~ 32780290 (-) True XLOC_002871
TCONS_00005772 lncRNA downstream 698885 32676810 ~ 32678245 (-) True XLOC_002870
TCONS_00006081 lncRNA downstream 785668 32584685 ~ 32591462 (-) True XLOC_002867
TCONS_00005338 lncRNA upstream 240410 33617624 ~ 33618942 (-) True XLOC_002889
TCONS_00006085 lncRNA upstream 285951 33663165 ~ 33664789 (-) True XLOC_002890
TCONS_00005339 lncRNA upstream 498917 33876131 ~ 33880364 (-) True XLOC_002891
TCONS_00006086 lncRNA upstream 819568 34196782 ~ 34198566 (-) True XLOC_002900
TCONS_00006087 lncRNA upstream 1375096 34752310 ~ 34772155 (-) False XLOC_002903
TCONS_00005327 mRNA downstream 33886 33305978 ~ 33343244 (-) True XLOC_002881
TCONS_00005326 mRNA downstream 79266 33269371 ~ 33297864 (-) True XLOC_002880
TCONS_00005325 mRNA downstream 111564 33253952 ~ 33265566 (-) True XLOC_002879
TCONS_00005324 mRNA downstream 125254 33240410 ~ 33251876 (-) True XLOC_002878
TCONS_00005321 mRNA downstream 220341 32903341 ~ 33156789 (-) True XLOC_002876
TCONS_00005332 mRNA upstream 167115 33544329 ~ 33557299 (-) True XLOC_002886
TCONS_00005333 mRNA upstream 184353 33561567 ~ 33572441 (-) True XLOC_002887
TCONS_00005334 mRNA upstream 203071 33580285 ~ 33588310 (-) False XLOC_002888
TCONS_00005335 mRNA upstream 203149 33580363 ~ 33588106 (-) True XLOC_002888
TCONS_00005336 mRNA upstream 237163 33614377 ~ 33621739 (-) False XLOC_002889
TCONS_00005330 other downstream 44 33377001 ~ 33377086 (-) True XLOC_002884
TCONS_00005329 other downstream 189 33376818 ~ 33376941 (-) True XLOC_002883
TCONS_00005308 other downstream 766361 32542536 ~ 32610769 (-) False XLOC_002866
TCONS_00005309 other downstream 766436 32567624 ~ 32610694 (-) True XLOC_002866
TCONS_00005293 other downstream 2272376 31021356 ~ 31104754 (-) True XLOC_002857
TCONS_00005343 other upstream 655069 34032283 ~ 34033421 (-) True XLOC_002893
TCONS_00005358 other upstream 950048 34327262 ~ 34327394 (-) True XLOC_002902
TCONS_00005381 other upstream 1607404 34984618 ~ 34992414 (-) False XLOC_002907
TCONS_00005403 other upstream 1992623 35369837 ~ 35387242 (-) True XLOC_002918
TCONS_00005406 other upstream 2243119 35620333 ~ 35620449 (-) True XLOC_002922