RNA id: TCONS_00060636



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00060636
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.58
exon number 1
gene id XLOC_031221
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 34833978 ~ 34834093 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


atcggcagctagctctctgcaactctcacgtggtcacccactgaagccaagcagggctgtgcccggtcagtacctggatgggagaccacataggaaaagctggattgctgccggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178688

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00060610 lncRNA downstream 1546394 33284809 ~ 33287584 (-) False XLOC_031208
TCONS_00060607 lncRNA downstream 1546405 33284503 ~ 33287573 (-) False XLOC_031208
TCONS_00060609 lncRNA downstream 1546417 33284721 ~ 33287561 (-) False XLOC_031208
TCONS_00060599 lncRNA downstream 1559563 33269436 ~ 33274415 (-) False XLOC_031207
TCONS_00062041 lncRNA downstream 1906059 32922656 ~ 32927919 (-) True XLOC_031200
TCONS_00062042 lncRNA upstream 368473 35202566 ~ 35206296 (-) True XLOC_031225
TCONS_00060651 lncRNA upstream 689316 35523409 ~ 35540980 (-) False XLOC_031229
TCONS_00060652 lncRNA upstream 692664 35526757 ~ 35540895 (-) True XLOC_031229
TCONS_00060655 lncRNA upstream 891454 35725547 ~ 35728227 (-) True XLOC_031230
TCONS_00062043 lncRNA upstream 1987781 36821874 ~ 36829073 (-) True XLOC_031238
TCONS_00060629 mRNA downstream 217379 34600714 ~ 34616599 (-) False XLOC_031219
TCONS_00060632 mRNA downstream 217379 34605797 ~ 34616599 (-) True XLOC_031219
TCONS_00060630 mRNA downstream 224641 34600930 ~ 34609337 (-) False XLOC_031219
TCONS_00060626 mRNA downstream 648481 34066591 ~ 34185497 (-) False XLOC_031217
TCONS_00060625 mRNA downstream 648863 34066591 ~ 34185115 (-) False XLOC_031217
TCONS_00060638 mRNA upstream 153355 34987448 ~ 34993242 (-) False XLOC_031222
TCONS_00060639 mRNA upstream 153355 34987448 ~ 34993245 (-) False XLOC_031222
TCONS_00060640 mRNA upstream 153364 34987457 ~ 34997630 (-) True XLOC_031222
TCONS_00060641 mRNA upstream 270992 35105085 ~ 35108893 (-) True XLOC_031223
TCONS_00060642 mRNA upstream 289569 35123662 ~ 35137365 (-) False XLOC_031224
TCONS_00060631 other downstream 218012 34603814 ~ 34615966 (-) False XLOC_031219
TCONS_00060628 other downstream 595955 34237907 ~ 34238023 (-) True XLOC_031218
TCONS_00060627 other downstream 683856 34142593 ~ 34150122 (-) True XLOC_031217
TCONS_00060622 other downstream 968778 33796998 ~ 33865200 (-) True XLOC_031214
TCONS_00060621 other downstream 1008507 33784860 ~ 33825471 (-) False XLOC_031214
TCONS_00060637 other upstream 84898 34918991 ~ 34964787 (-) True XLOC_031220
TCONS_00060656 other upstream 989325 35823418 ~ 35823548 (-) True XLOC_031231
TCONS_00060682 other upstream 2433154 37267247 ~ 37268199 (-) True XLOC_031247
TCONS_00060692 other upstream 3056514 37890607 ~ 37894891 (-) False XLOC_031255
TCONS_00060699 other upstream 3114761 37948854 ~ 37963763 (-) False XLOC_031257

Expression Profile


//