RNA id: TCONS_00062246


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00062246
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_031773
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 3165608 ~ 3165722 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ACCAGCAGCTTGCTCCCTGCAACtttcacatggttgcccactgaagctaagcagggctgcgcctggtatgtacctgaatgggagaccacactggaaagctaggttgctgccggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000187535

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064598 lncRNA upstream 545270 2617389 ~ 2620338 (+) True XLOC_031771
TCONS_00062238 lncRNA upstream 572108 2519973 ~ 2593500 (+) False XLOC_031770
TCONS_00062237 lncRNA upstream 572108 2519973 ~ 2593500 (+) False XLOC_031770
TCONS_00062239 lncRNA upstream 615446 2522220 ~ 2550162 (+) True XLOC_031770
TCONS_00062236 lncRNA upstream 659156 2492464 ~ 2506452 (+) True XLOC_031769
TCONS_00064796 lncRNA downstream 254054 3419776 ~ 3422733 (+) True XLOC_031776
TCONS_00064599 lncRNA downstream 409329 3575051 ~ 3581291 (+) True XLOC_031780
TCONS_00062270 lncRNA downstream 650327 3816049 ~ 3826125 (+) True XLOC_031787
TCONS_00064797 lncRNA downstream 662055 3827777 ~ 3850242 (+) False XLOC_031788
TCONS_00064798 lncRNA downstream 711950 3877672 ~ 3879215 (+) True XLOC_031790
TCONS_00062234 mRNA upstream 701560 2457455 ~ 2464048 (+) True XLOC_031768
TCONS_00062233 mRNA upstream 770595 2271559 ~ 2395013 (+) True XLOC_031767
TCONS_00062229 mRNA upstream 966925 2195625 ~ 2198683 (+) True XLOC_031763
TCONS_00062227 mRNA upstream 967440 2174082 ~ 2198168 (+) False XLOC_031763
TCONS_00062228 mRNA upstream 967442 2190214 ~ 2198166 (+) False XLOC_031763
TCONS_00062247 mRNA downstream 1219 3166941 ~ 3273647 (+) False XLOC_031772
TCONS_00062249 mRNA downstream 115217 3280939 ~ 3319142 (+) False XLOC_031774
TCONS_00062250 mRNA downstream 117087 3282809 ~ 3293355 (+) False XLOC_031774
TCONS_00062252 mRNA downstream 117087 3282809 ~ 3318656 (+) False XLOC_031774
TCONS_00062251 mRNA downstream 117087 3282809 ~ 3318656 (+) True XLOC_031774
TCONS_00062191 other upstream 3060886 103361 ~ 104722 (+) False XLOC_031731
TCONS_00062248 other downstream 52641 3218363 ~ 3249470 (+) True XLOC_031772
TCONS_00062273 other downstream 662055 3827777 ~ 3838228 (+) False XLOC_031788
TCONS_00062276 other downstream 668720 3834442 ~ 3850242 (+) True XLOC_031788
TCONS_00062297 other downstream 2518459 5684181 ~ 5684295 (+) True XLOC_031803
TCONS_00062300 other downstream 3050072 6215794 ~ 6215910 (+) True XLOC_031807