RNA id: TCONS_00062324



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00062324
length 123
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_031817
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 6879927 ~ 6880049 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AGCCACAGCCGTATGACCTGAAGTGAGTAACCCAAGAcctgttactcactgaagctaagcagggctgaggctggtcagtgtcaggatgggagaccacatgggaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119551

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00062317 lncRNA upstream 71587 6802528 ~ 6808340 (+) False XLOC_031814
TCONS_00062315 lncRNA upstream 79669 6799291 ~ 6800258 (+) True XLOC_031813
TCONS_00062313 lncRNA upstream 86751 6789659 ~ 6793176 (+) True XLOC_031812
TCONS_00064805 lncRNA upstream 90984 6786638 ~ 6788943 (+) False XLOC_031812
TCONS_00062325 lncRNA downstream 14179 6894228 ~ 6900683 (+) True XLOC_031816
TCONS_00064806 lncRNA downstream 327544 7207593 ~ 7208629 (+) True XLOC_031820
TCONS_00062339 lncRNA downstream 549262 7429311 ~ 7435700 (+) True XLOC_031826
TCONS_00062351 lncRNA downstream 770678 7650727 ~ 7652412 (+) True XLOC_031831
TCONS_00062354 lncRNA downstream 1210374 8090423 ~ 8093799 (+) False XLOC_031833
TCONS_00062319 mRNA upstream 33934 6822592 ~ 6845993 (+) False XLOC_031815
TCONS_00062320 mRNA upstream 33934 6828167 ~ 6845993 (+) False XLOC_031815
TCONS_00062318 mRNA upstream 70329 6802582 ~ 6809598 (+) True XLOC_031814
TCONS_00062316 mRNA upstream 71417 6802142 ~ 6808510 (+) False XLOC_031814
TCONS_00062314 mRNA upstream 79540 6797520 ~ 6800387 (+) False XLOC_031813
TCONS_00062326 mRNA downstream 44588 6924637 ~ 6962195 (+) False XLOC_031818
TCONS_00062327 mRNA downstream 44588 6924637 ~ 6967588 (+) True XLOC_031818
TCONS_00062328 mRNA downstream 243931 7123980 ~ 7132026 (+) False XLOC_031819
TCONS_00062329 mRNA downstream 244021 7124070 ~ 7133531 (+) True XLOC_031819
TCONS_00062330 mRNA downstream 360354 7240403 ~ 7245216 (+) True XLOC_031821
TCONS_00062321 other upstream 47306 6832046 ~ 6832621 (+) True XLOC_031815
TCONS_00062305 other upstream 606450 6271867 ~ 6273477 (+) True XLOC_031808
TCONS_00062300 other upstream 664017 6215794 ~ 6215910 (+) True XLOC_031807
TCONS_00062297 other upstream 1195632 5684181 ~ 5684295 (+) True XLOC_031803
TCONS_00062276 other upstream 3029685 3834442 ~ 3850242 (+) True XLOC_031788
TCONS_00062341 other downstream 573306 7453355 ~ 7453831 (+) True XLOC_031828
TCONS_00062343 other downstream 586224 7466273 ~ 7472497 (+) False XLOC_031829
TCONS_00062345 other downstream 620079 7500128 ~ 7505016 (+) False XLOC_031829
TCONS_00062355 other downstream 1210528 8090577 ~ 8093799 (+) True XLOC_031833
TCONS_00062362 other downstream 1434474 8314523 ~ 8321969 (+) False XLOC_031838

Expression Profile


//