RNA id: TCONS_00062341



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00062341
length 477
RNA type TEC
GC content 0.47
exon number 1
gene id XLOC_031828
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 7453355 ~ 7453831 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CCTTTTTTTCTGATAGGGCGACActgtggcccagtggctagcactgttgcctcatagcaagaacaccgctggtccaacctcctatcggGCCTGTTGGCctttctgtgcggagtttctatgttctccccgtgtttcctTGGGTTTTTCTCCCGCCTtccaaaaacatacaccatagccaatcgactaaaccaaattatcacccaagacaacctgagtttacacttctcacacggtgacaagcaggggagttcttgagacctacctgagctcaaactcccctctcgcccttctattcggagggagccccaggctcgaggatattacgagctcagggctctctcccgggacagcatgctaattacgctttattgattatcagctaagtgtgaactcttgaaatatggattttttaaatgcagcgtttatttaaatattgcagTAATTGCCATCCCAATAAATCCAaatgtgctaaatatt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000169858

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00062339 lncRNA upstream 17655 7429311 ~ 7435700 (+) True XLOC_031826
TCONS_00064806 lncRNA upstream 244726 7207593 ~ 7208629 (+) True XLOC_031820
TCONS_00062325 lncRNA upstream 552672 6894228 ~ 6900683 (+) True XLOC_031816
TCONS_00062317 lncRNA upstream 645015 6802528 ~ 6808340 (+) False XLOC_031814
TCONS_00062315 lncRNA upstream 653097 6799291 ~ 6800258 (+) True XLOC_031813
TCONS_00062351 lncRNA downstream 196896 7650727 ~ 7652412 (+) True XLOC_031831
TCONS_00062354 lncRNA downstream 636592 8090423 ~ 8093799 (+) False XLOC_031833
TCONS_00064807 lncRNA downstream 810933 8264764 ~ 8271403 (+) True XLOC_031837
TCONS_00062364 lncRNA downstream 885440 8339271 ~ 8346941 (+) True XLOC_031839
TCONS_00064808 lncRNA downstream 996480 8450311 ~ 8453642 (+) True XLOC_031840
TCONS_00062340 mRNA upstream 796 7444899 ~ 7452559 (+) True XLOC_031827
TCONS_00062338 mRNA upstream 25843 7421898 ~ 7427512 (+) True XLOC_031825
TCONS_00062337 mRNA upstream 38012 7414215 ~ 7415343 (+) True XLOC_031824
TCONS_00062336 mRNA upstream 62897 7322587 ~ 7390458 (+) True XLOC_031823
TCONS_00062332 mRNA upstream 173056 7249531 ~ 7280299 (+) False XLOC_031822
TCONS_00062342 mRNA downstream 12392 7466223 ~ 7531427 (+) False XLOC_031829
TCONS_00062344 mRNA downstream 36323 7490154 ~ 7529487 (+) False XLOC_031829
TCONS_00062346 mRNA downstream 53559 7507390 ~ 7511762 (+) True XLOC_031829
TCONS_00062347 mRNA downstream 79770 7533601 ~ 7551140 (+) True XLOC_031830
TCONS_00062349 mRNA downstream 99254 7553085 ~ 7658285 (+) False XLOC_031831
TCONS_00062324 other upstream 573306 6879927 ~ 6880049 (+) True XLOC_031817
TCONS_00062321 other upstream 620734 6832046 ~ 6832621 (+) True XLOC_031815
TCONS_00062305 other upstream 1179878 6271867 ~ 6273477 (+) True XLOC_031808
TCONS_00062300 other upstream 1237445 6215794 ~ 6215910 (+) True XLOC_031807
TCONS_00062297 other upstream 1769060 5684181 ~ 5684295 (+) True XLOC_031803
TCONS_00062343 other downstream 12442 7466273 ~ 7472497 (+) False XLOC_031829
TCONS_00062345 other downstream 46297 7500128 ~ 7505016 (+) False XLOC_031829
TCONS_00062355 other downstream 636746 8090577 ~ 8093799 (+) True XLOC_031833
TCONS_00062362 other downstream 860692 8314523 ~ 8321969 (+) False XLOC_031838
TCONS_00062371 other downstream 1237577 8691408 ~ 8691993 (+) True XLOC_031844

Expression Profile


//