RNA id: TCONS_00062373



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00062373
length 121
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_031846
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 8771476 ~ 8771596 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tgccacagccatatcaccctacaGCCCTAGAGTGGTTACTCACTGTTTGAAGCTAATCAGGtttgagcctggtcagtacctggatgggagaccacatgagacaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117408

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064809 lncRNA upstream 29748 8708788 ~ 8741728 (+) False XLOC_031845
TCONS_00064808 lncRNA upstream 317834 8450311 ~ 8453642 (+) True XLOC_031840
TCONS_00062364 lncRNA upstream 424535 8339271 ~ 8346941 (+) True XLOC_031839
TCONS_00064807 lncRNA upstream 500073 8264764 ~ 8271403 (+) True XLOC_031837
TCONS_00062354 lncRNA upstream 677677 8090423 ~ 8093799 (+) False XLOC_031833
TCONS_00064601 lncRNA downstream 138110 8909706 ~ 8997994 (+) True XLOC_031845
TCONS_00062375 lncRNA downstream 344614 9116210 ~ 9122999 (+) True XLOC_031847
TCONS_00064811 lncRNA downstream 371288 9142884 ~ 9146483 (+) True XLOC_031849
TCONS_00062378 lncRNA downstream 383656 9155252 ~ 9156475 (+) False XLOC_031850
TCONS_00062380 lncRNA downstream 391411 9163007 ~ 9164205 (+) False XLOC_031851
TCONS_00062370 mRNA upstream 87406 8652310 ~ 8684070 (+) True XLOC_031843
TCONS_00062366 mRNA upstream 121155 8622228 ~ 8650321 (+) False XLOC_031842
TCONS_00062374 mRNA downstream 335467 9107063 ~ 9130843 (+) False XLOC_031847
TCONS_00062376 mRNA downstream 359393 9130989 ~ 9139986 (+) True XLOC_031848
TCONS_00062377 mRNA downstream 371135 9142731 ~ 9150376 (+) False XLOC_031849
TCONS_00062379 mRNA downstream 383675 9155271 ~ 9161393 (+) True XLOC_031850
TCONS_00062381 mRNA downstream 391430 9163026 ~ 9173106 (+) False XLOC_031851
TCONS_00062371 other upstream 79483 8691408 ~ 8691993 (+) True XLOC_031844
TCONS_00062362 other upstream 449507 8314523 ~ 8321969 (+) False XLOC_031838
TCONS_00062355 other upstream 677677 8090577 ~ 8093799 (+) True XLOC_031833
TCONS_00062345 other upstream 1266460 7500128 ~ 7505016 (+) False XLOC_031829
TCONS_00062343 other upstream 1298979 7466273 ~ 7472497 (+) False XLOC_031829
TCONS_00062400 other downstream 1106117 9877713 ~ 9878219 (+) False XLOC_031862
TCONS_00062404 other downstream 1129528 9901124 ~ 9908762 (+) False XLOC_031864
TCONS_00062432 other downstream 2095428 10867024 ~ 10867141 (+) True XLOC_031883
TCONS_00062436 other downstream 2246820 11018416 ~ 11018532 (+) True XLOC_031889
TCONS_00062446 other downstream 2626045 11397641 ~ 11408137 (+) False XLOC_031893