RNA id: TCONS_00064674


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064674
length 264
lncRNA type inter_gene
GC content 0.44
exon number 1
gene id XLOC_032164
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 36714359 ~ 36714622 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ggaggactgcatcaatCCATCTCTGCAACAACTCAAACTTTTCAACTTTtcaagtcatctggaatgccaaagaaagcgttcttgcaggacttccagagttcatcaatattcttttgattcatctttaatgcctcctcctttattttaccccagacatgctcaataatgttcatgtctggtgactgggctgacaaATCCTGGAGCACATTGGCCTTGTGGATGCGGAAGTGTAAGAacgagcgctatcctgctgaagaatgtgcc

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064889 lncRNA upstream 95861 36472621 ~ 36618498 (+) False XLOC_032162
TCONS_00064893 lncRNA upstream 95861 36472672 ~ 36618498 (+) False XLOC_032162
TCONS_00064892 lncRNA upstream 122151 36472672 ~ 36592208 (+) False XLOC_032162
TCONS_00064891 lncRNA upstream 134081 36472660 ~ 36580278 (+) False XLOC_032162
TCONS_00064890 lncRNA upstream 140888 36472629 ~ 36573471 (+) False XLOC_032162
TCONS_00062852 lncRNA downstream 93182 36807804 ~ 36819369 (+) False XLOC_032165
TCONS_00062853 lncRNA downstream 102526 36817148 ~ 36818183 (+) True XLOC_032165
TCONS_00064894 lncRNA downstream 469571 37184193 ~ 37247650 (+) False XLOC_032172
TCONS_00064895 lncRNA downstream 469571 37184193 ~ 37250364 (+) False XLOC_032172
TCONS_00064896 lncRNA downstream 469577 37184199 ~ 37217476 (+) False XLOC_032172
TCONS_00062846 mRNA upstream 250664 36459897 ~ 36463695 (+) False XLOC_032161
TCONS_00062847 mRNA upstream 252128 36459962 ~ 36462231 (+) True XLOC_032161
TCONS_00062845 mRNA upstream 322672 36381709 ~ 36391687 (+) True XLOC_032159
TCONS_00062829 mRNA upstream 1347415 35362225 ~ 35366944 (+) False XLOC_032153
TCONS_00062828 mRNA upstream 1347415 35362225 ~ 35366944 (+) True XLOC_032153
TCONS_00062851 mRNA downstream 80603 36795225 ~ 36818959 (+) False XLOC_032165
TCONS_00062854 mRNA downstream 106999 36821621 ~ 36837536 (+) True XLOC_032166
TCONS_00062855 mRNA downstream 124887 36839509 ~ 36844020 (+) False XLOC_032167
TCONS_00062856 mRNA downstream 125008 36839630 ~ 36843887 (+) True XLOC_032167
TCONS_00062857 mRNA downstream 129505 36844127 ~ 36877587 (+) True XLOC_032168
TCONS_00062849 other upstream 172257 36472721 ~ 36542102 (+) True XLOC_032162
TCONS_00062850 other upstream 202429 36511812 ~ 36511930 (+) True XLOC_032163
TCONS_00062848 other upstream 241411 36465347 ~ 36472948 (+) False XLOC_032162
TCONS_00062831 other upstream 918740 35794799 ~ 35795619 (+) True XLOC_032155
TCONS_00062813 other upstream 2772517 33937379 ~ 33941842 (+) True XLOC_032140
TCONS_00062861 other downstream 275948 36990570 ~ 36990684 (+) True XLOC_032171
TCONS_00062862 other downstream 479286 37193908 ~ 37216188 (+) True XLOC_032172
TCONS_00062866 other downstream 619937 37334559 ~ 37334963 (+) True XLOC_032176
TCONS_00062877 other downstream 1000650 37715272 ~ 37717110 (+) False XLOC_032181
TCONS_00062883 other downstream 1372873 38087495 ~ 38087611 (+) True XLOC_032184

Expression Profile

//