RNA id: TCONS_00062861


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00062861
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_032171
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 36990570 ~ 36990684 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GTCGGCAGCTAGCTCTTTGCAAGTCTCACAtgatcgcccactgaagctaatcaGGGCTGCGCTTGGTCAGTTTCTGGTtgggagactacatgggaaagctgggtatttgtcggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000186744

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00062852 lncRNA upstream 171201 36807804 ~ 36819369 (+) False XLOC_032165
TCONS_00062853 lncRNA upstream 172387 36817148 ~ 36818183 (+) True XLOC_032165
TCONS_00064674 lncRNA upstream 275948 36714359 ~ 36714622 (+) True XLOC_032164
TCONS_00064889 lncRNA upstream 372072 36472621 ~ 36618498 (+) False XLOC_032162
TCONS_00064893 lncRNA upstream 372072 36472672 ~ 36618498 (+) False XLOC_032162
TCONS_00064894 lncRNA downstream 193509 37184193 ~ 37247650 (+) False XLOC_032172
TCONS_00064895 lncRNA downstream 193509 37184193 ~ 37250364 (+) False XLOC_032172
TCONS_00064896 lncRNA downstream 193515 37184199 ~ 37217476 (+) False XLOC_032172
TCONS_00064897 lncRNA downstream 193623 37184307 ~ 37247650 (+) False XLOC_032172
TCONS_00064898 lncRNA downstream 193651 37184335 ~ 37247650 (+) False XLOC_032172
TCONS_00062859 mRNA upstream 89440 36878815 ~ 36901130 (+) True XLOC_032169
TCONS_00062858 mRNA upstream 93577 36877968 ~ 36896993 (+) False XLOC_032169
TCONS_00062857 mRNA upstream 112983 36844127 ~ 36877587 (+) True XLOC_032168
TCONS_00062855 mRNA upstream 146550 36839509 ~ 36844020 (+) False XLOC_032167
TCONS_00062856 mRNA upstream 146683 36839630 ~ 36843887 (+) True XLOC_032167
TCONS_00062863 mRNA downstream 310657 37301341 ~ 37307487 (+) False XLOC_032173
TCONS_00062865 mRNA downstream 318032 37308716 ~ 37311049 (+) True XLOC_032174
TCONS_00062867 mRNA downstream 451105 37441789 ~ 37454910 (+) True XLOC_032177
TCONS_00062870 mRNA downstream 538699 37529383 ~ 37600648 (+) False XLOC_032179
TCONS_00062869 mRNA downstream 538699 37529383 ~ 37600648 (+) False XLOC_032179
TCONS_00062849 other upstream 448468 36472721 ~ 36542102 (+) True XLOC_032162
TCONS_00062850 other upstream 478640 36511812 ~ 36511930 (+) True XLOC_032163
TCONS_00062848 other upstream 517622 36465347 ~ 36472948 (+) False XLOC_032162
TCONS_00062831 other upstream 1194951 35794799 ~ 35795619 (+) True XLOC_032155
TCONS_00062813 other upstream 3048728 33937379 ~ 33941842 (+) True XLOC_032140
TCONS_00062862 other downstream 203224 37193908 ~ 37216188 (+) True XLOC_032172
TCONS_00062866 other downstream 343875 37334559 ~ 37334963 (+) True XLOC_032176
TCONS_00062877 other downstream 724588 37715272 ~ 37717110 (+) False XLOC_032181
TCONS_00062883 other downstream 1096811 38087495 ~ 38087611 (+) True XLOC_032184
TCONS_00062884 other downstream 1386407 38377091 ~ 38377211 (+) True XLOC_032186