RNA id: TCONS_00062987



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00062987
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_032251
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 41194687 ~ 41194801 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gtcggcagctagctctctgtgACTCTCACATGGTCAACCACTGAAGCTAAGCTAGGCTGCGCCcgttcagtacctggatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgccgaaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000180989

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00062980 lncRNA upstream 92383 41096173 ~ 41102304 (+) False XLOC_032246
TCONS_00064922 lncRNA upstream 111702 41080510 ~ 41082985 (+) True XLOC_032245
TCONS_00064921 lncRNA upstream 208552 40984597 ~ 40986135 (+) True XLOC_032242
TCONS_00062966 lncRNA upstream 353786 40837650 ~ 40840901 (+) True XLOC_032238
TCONS_00062958 lncRNA upstream 530370 40662533 ~ 40664317 (+) True XLOC_032232
TCONS_00063001 lncRNA downstream 310314 41505115 ~ 41505986 (+) True XLOC_032258
TCONS_00063004 lncRNA downstream 439268 41634069 ~ 41648856 (+) False XLOC_032259
TCONS_00063005 lncRNA downstream 439378 41634179 ~ 41670341 (+) False XLOC_032259
TCONS_00063006 lncRNA downstream 496293 41691094 ~ 41710148 (+) True XLOC_032259
TCONS_00064923 lncRNA downstream 570837 41765638 ~ 41773554 (+) False XLOC_032260
TCONS_00062986 mRNA upstream 1268 41191482 ~ 41193419 (+) True XLOC_032250
TCONS_00062985 mRNA upstream 5227 41186320 ~ 41189460 (+) True XLOC_032249
TCONS_00062984 mRNA upstream 10864 41181869 ~ 41183823 (+) True XLOC_032248
TCONS_00062983 mRNA upstream 33670 41144203 ~ 41161017 (+) True XLOC_032247
TCONS_00062982 mRNA upstream 34143 41144155 ~ 41160544 (+) False XLOC_032247
TCONS_00062988 mRNA downstream 5699 41200500 ~ 41202554 (+) True XLOC_032252
TCONS_00062989 mRNA downstream 60684 41255485 ~ 41445565 (+) False XLOC_032253
TCONS_00062990 mRNA downstream 60802 41255603 ~ 41446053 (+) True XLOC_032253
TCONS_00062991 mRNA downstream 251740 41446541 ~ 41451844 (+) False XLOC_032254
TCONS_00062992 mRNA downstream 251749 41446550 ~ 41451493 (+) False XLOC_032254
TCONS_00062945 other upstream 647712 40545865 ~ 40546975 (+) False XLOC_032225
TCONS_00062936 other upstream 1145242 40043615 ~ 40049445 (+) True XLOC_032217
TCONS_00062919 other upstream 1822812 39370620 ~ 39371875 (+) True XLOC_032204
TCONS_00062894 other upstream 2336385 38845676 ~ 38858302 (+) False XLOC_032191
TCONS_00062893 other upstream 2412529 38773418 ~ 38782158 (+) True XLOC_032190
TCONS_00062995 other downstream 259990 41454791 ~ 41454873 (+) True XLOC_032256
TCONS_00062996 other downstream 268984 41463785 ~ 41493470 (+) False XLOC_032257
TCONS_00063008 other downstream 658571 41853372 ~ 41869189 (+) True XLOC_032262
TCONS_00063013 other downstream 803162 41997963 ~ 41998096 (+) True XLOC_032265
TCONS_00063014 other downstream 967849 42162650 ~ 42162774 (+) True XLOC_032266