RNA id: TCONS_00062995


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00062995
length 83
RNA type miRNA
GC content 0.45
exon number 1
gene id XLOC_032256
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 41454791 ~ 41454873 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GGTTGAGGTAGTTGTTTGTACAGTTTTTAGGGTCTGTTATTCTGCCCTGTTAAGGAGCTAACTGTACAGACTACTGCCTTGCC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117363

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00062980 lncRNA upstream 352487 41096173 ~ 41102304 (+) False XLOC_032246
TCONS_00064922 lncRNA upstream 371806 41080510 ~ 41082985 (+) True XLOC_032245
TCONS_00064921 lncRNA upstream 468656 40984597 ~ 40986135 (+) True XLOC_032242
TCONS_00062966 lncRNA upstream 613890 40837650 ~ 40840901 (+) True XLOC_032238
TCONS_00062958 lncRNA upstream 790474 40662533 ~ 40664317 (+) True XLOC_032232
TCONS_00063001 lncRNA downstream 50242 41505115 ~ 41505986 (+) True XLOC_032258
TCONS_00063004 lncRNA downstream 179196 41634069 ~ 41648856 (+) False XLOC_032259
TCONS_00063005 lncRNA downstream 179306 41634179 ~ 41670341 (+) False XLOC_032259
TCONS_00063006 lncRNA downstream 236221 41691094 ~ 41710148 (+) True XLOC_032259
TCONS_00064923 lncRNA downstream 310765 41765638 ~ 41773554 (+) False XLOC_032260
TCONS_00062991 mRNA upstream 2947 41446541 ~ 41451844 (+) False XLOC_032254
TCONS_00062992 mRNA upstream 3298 41446550 ~ 41451493 (+) False XLOC_032254
TCONS_00062993 mRNA upstream 3482 41446607 ~ 41451309 (+) True XLOC_032254
TCONS_00062990 mRNA upstream 8738 41255603 ~ 41446053 (+) True XLOC_032253
TCONS_00062989 mRNA upstream 9226 41255485 ~ 41445565 (+) False XLOC_032253
TCONS_00062997 mRNA downstream 8913 41463786 ~ 41501766 (+) True XLOC_032257
TCONS_00062998 mRNA downstream 48981 41503854 ~ 41506112 (+) False XLOC_032258
TCONS_00062999 mRNA downstream 49098 41503971 ~ 41505239 (+) False XLOC_032258
TCONS_00063000 mRNA downstream 49247 41504120 ~ 41506749 (+) False XLOC_032258
TCONS_00063002 mRNA downstream 99921 41554794 ~ 41755753 (+) False XLOC_032259
TCONS_00062987 other upstream 259990 41194687 ~ 41194801 (+) True XLOC_032251
TCONS_00062945 other upstream 907816 40545865 ~ 40546975 (+) False XLOC_032225
TCONS_00062936 other upstream 1405346 40043615 ~ 40049445 (+) True XLOC_032217
TCONS_00062919 other upstream 2082916 39370620 ~ 39371875 (+) True XLOC_032204
TCONS_00062894 other upstream 2596489 38845676 ~ 38858302 (+) False XLOC_032191
TCONS_00062996 other downstream 8912 41463785 ~ 41493470 (+) False XLOC_032257
TCONS_00063008 other downstream 398499 41853372 ~ 41869189 (+) True XLOC_032262
TCONS_00063013 other downstream 543090 41997963 ~ 41998096 (+) True XLOC_032265
TCONS_00063014 other downstream 707777 42162650 ~ 42162774 (+) True XLOC_032266
TCONS_00063021 other downstream 1164029 42618902 ~ 42622652 (+) True XLOC_032272