RNA id: TCONS_00063013


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00063013
length 134
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_032265
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 41997963 ~ 41998096 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AATCGCGCCTCAGCACAGTTCAGGCACCTAATGTGAGTTAGccctcacatggttgcccactgaagccaagcagggctgctgttggtcagtacctggatggaggACCACATTGGAAAGCTTGGTTACTGTGGTTA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120883

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00063010 lncRNA upstream 82950 41909373 ~ 41915013 (+) True XLOC_032263
TCONS_00063009 lncRNA upstream 87493 41909373 ~ 41910470 (+) False XLOC_032263
TCONS_00064680 lncRNA upstream 87556 41896384 ~ 41910407 (+) False XLOC_032263
TCONS_00064927 lncRNA upstream 209549 41779149 ~ 41788414 (+) False XLOC_032261
TCONS_00064928 lncRNA upstream 214676 41780484 ~ 41783287 (+) True XLOC_032261
TCONS_00063016 lncRNA downstream 385098 42383194 ~ 42383446 (+) True XLOC_032268
TCONS_00063020 lncRNA downstream 606145 42604241 ~ 42610935 (+) False XLOC_032271
TCONS_00064929 lncRNA downstream 610446 42608542 ~ 42610935 (+) True XLOC_032271
TCONS_00064931 lncRNA downstream 658617 42656713 ~ 42666008 (+) False XLOC_032275
TCONS_00064930 lncRNA downstream 658617 42656713 ~ 42666008 (+) False XLOC_032275
TCONS_00063011 mRNA upstream 23758 41956355 ~ 41974205 (+) False XLOC_032264
TCONS_00063012 mRNA upstream 23758 41957280 ~ 41974205 (+) True XLOC_032264
TCONS_00063007 mRNA upstream 110565 41808673 ~ 41887398 (+) False XLOC_032262
TCONS_00063003 mRNA upstream 240782 41555247 ~ 41757181 (+) False XLOC_032259
TCONS_00063002 mRNA upstream 242210 41554794 ~ 41755753 (+) False XLOC_032259
TCONS_00063015 mRNA downstream 340213 42338309 ~ 42341219 (+) True XLOC_032267
TCONS_00063017 mRNA downstream 477634 42475730 ~ 42505007 (+) True XLOC_032269
TCONS_00063018 mRNA downstream 547701 42545797 ~ 42598011 (+) False XLOC_032270
TCONS_00063019 mRNA downstream 589541 42587637 ~ 42598328 (+) True XLOC_032270
TCONS_00063026 mRNA downstream 668598 42666694 ~ 42690736 (+) False XLOC_032276
TCONS_00063008 other upstream 128774 41853372 ~ 41869189 (+) True XLOC_032262
TCONS_00062996 other upstream 504493 41463785 ~ 41493470 (+) False XLOC_032257
TCONS_00062995 other upstream 543090 41454791 ~ 41454873 (+) True XLOC_032256
TCONS_00062987 other upstream 803162 41194687 ~ 41194801 (+) True XLOC_032251
TCONS_00062945 other upstream 1450988 40545865 ~ 40546975 (+) False XLOC_032225
TCONS_00063014 other downstream 164554 42162650 ~ 42162774 (+) True XLOC_032266
TCONS_00063021 other downstream 620806 42618902 ~ 42622652 (+) True XLOC_032272
TCONS_00063022 other downstream 637864 42635960 ~ 42643033 (+) True XLOC_032273
TCONS_00063023 other downstream 648315 42646411 ~ 42653425 (+) True XLOC_032274
TCONS_00063027 other downstream 676517 42674613 ~ 42680610 (+) True XLOC_032276