RNA id: TCONS_00063014



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00063014
length 125
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_032266
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 42162650 ~ 42162774 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GGCCACAGCCTTATCACTTATCACCCTACAGCTCAAGACCAGGTtaatcactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctagatgggagaccacatgggaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116198

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00063010 lncRNA upstream 247637 41909373 ~ 41915013 (+) True XLOC_032263
TCONS_00063009 lncRNA upstream 252180 41909373 ~ 41910470 (+) False XLOC_032263
TCONS_00064680 lncRNA upstream 252243 41896384 ~ 41910407 (+) False XLOC_032263
TCONS_00064927 lncRNA upstream 374236 41779149 ~ 41788414 (+) False XLOC_032261
TCONS_00063016 lncRNA downstream 220420 42383194 ~ 42383446 (+) True XLOC_032268
TCONS_00063020 lncRNA downstream 441467 42604241 ~ 42610935 (+) False XLOC_032271
TCONS_00064929 lncRNA downstream 445768 42608542 ~ 42610935 (+) True XLOC_032271
TCONS_00064931 lncRNA downstream 493939 42656713 ~ 42666008 (+) False XLOC_032275
TCONS_00064930 lncRNA downstream 493939 42656713 ~ 42666008 (+) False XLOC_032275
TCONS_00063011 mRNA upstream 188445 41956355 ~ 41974205 (+) False XLOC_032264
TCONS_00063012 mRNA upstream 188445 41957280 ~ 41974205 (+) True XLOC_032264
TCONS_00063007 mRNA upstream 275252 41808673 ~ 41887398 (+) False XLOC_032262
TCONS_00063003 mRNA upstream 405469 41555247 ~ 41757181 (+) False XLOC_032259
TCONS_00063002 mRNA upstream 406897 41554794 ~ 41755753 (+) False XLOC_032259
TCONS_00063015 mRNA downstream 175535 42338309 ~ 42341219 (+) True XLOC_032267
TCONS_00063017 mRNA downstream 312956 42475730 ~ 42505007 (+) True XLOC_032269
TCONS_00063018 mRNA downstream 383023 42545797 ~ 42598011 (+) False XLOC_032270
TCONS_00063019 mRNA downstream 424863 42587637 ~ 42598328 (+) True XLOC_032270
TCONS_00063026 mRNA downstream 503920 42666694 ~ 42690736 (+) False XLOC_032276
TCONS_00063013 other upstream 164554 41997963 ~ 41998096 (+) True XLOC_032265
TCONS_00063008 other upstream 293461 41853372 ~ 41869189 (+) True XLOC_032262
TCONS_00062996 other upstream 669180 41463785 ~ 41493470 (+) False XLOC_032257
TCONS_00062995 other upstream 707777 41454791 ~ 41454873 (+) True XLOC_032256
TCONS_00062987 other upstream 967849 41194687 ~ 41194801 (+) True XLOC_032251
TCONS_00063021 other downstream 456128 42618902 ~ 42622652 (+) True XLOC_032272
TCONS_00063022 other downstream 473186 42635960 ~ 42643033 (+) True XLOC_032273
TCONS_00063023 other downstream 483637 42646411 ~ 42653425 (+) True XLOC_032274
TCONS_00063027 other downstream 511839 42674613 ~ 42680610 (+) True XLOC_032276
TCONS_00063042 other downstream 1336297 43499071 ~ 43502279 (+) True XLOC_032286

Expression Profile


//