RNA id: TCONS_00063044


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00063044
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_032289
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 44132968 ~ 44133082 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

aatggcagctAGCTCACTGCAACTCTTACAAGGTTGGTCACTGAAACCAAGCAGGAatgcacccggtcagtacctggatgggagaccacatgagaaagctaggttgctgccggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000182599

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064941 lncRNA upstream 531096 43597596 ~ 43601872 (+) False XLOC_032287
TCONS_00064942 lncRNA upstream 531096 43599886 ~ 43601872 (+) True XLOC_032287
TCONS_00064939 lncRNA upstream 585980 43498980 ~ 43546988 (+) False XLOC_032286
TCONS_00064938 lncRNA upstream 585980 43498980 ~ 43546988 (+) False XLOC_032286
TCONS_00064940 lncRNA upstream 630738 43499055 ~ 43502230 (+) False XLOC_032286
TCONS_00064943 lncRNA downstream 267560 44400642 ~ 44582954 (+) False XLOC_032292
TCONS_00064944 lncRNA downstream 267560 44400642 ~ 44593150 (+) False XLOC_032292
TCONS_00064945 lncRNA downstream 267560 44400642 ~ 44720504 (+) False XLOC_032292
TCONS_00064946 lncRNA downstream 267665 44400747 ~ 44720504 (+) False XLOC_032292
TCONS_00063048 lncRNA downstream 267675 44400757 ~ 44418551 (+) False XLOC_032292
TCONS_00063043 mRNA upstream 225647 43903209 ~ 43907321 (+) True XLOC_032288
TCONS_00063041 mRNA upstream 658211 43450221 ~ 43474757 (+) True XLOC_032285
TCONS_00063039 mRNA upstream 699691 43400059 ~ 43433277 (+) False XLOC_032284
TCONS_00063040 mRNA upstream 699691 43426599 ~ 43433277 (+) True XLOC_032284
TCONS_00063038 mRNA upstream 705231 43390387 ~ 43427737 (+) False XLOC_032284
TCONS_00063045 mRNA downstream 30645 44163727 ~ 44193740 (+) True XLOC_032290
TCONS_00063046 mRNA downstream 64017 44197099 ~ 44209390 (+) False XLOC_032291
TCONS_00063047 mRNA downstream 64266 44197348 ~ 44207671 (+) True XLOC_032291
TCONS_00063051 mRNA downstream 679362 44812444 ~ 44977428 (+) False XLOC_032294
TCONS_00063052 mRNA downstream 679362 44812444 ~ 44977428 (+) False XLOC_032294
TCONS_00063042 other upstream 630689 43499071 ~ 43502279 (+) True XLOC_032286
TCONS_00063027 other upstream 1452358 42674613 ~ 42680610 (+) True XLOC_032276
TCONS_00063023 other upstream 1479543 42646411 ~ 42653425 (+) True XLOC_032274
TCONS_00063022 other upstream 1489935 42635960 ~ 42643033 (+) True XLOC_032273
TCONS_00063021 other upstream 1510316 42618902 ~ 42622652 (+) True XLOC_032272
TCONS_00063059 other downstream 1222327 45355409 ~ 45355525 (+) True XLOC_032298
TCONS_00063061 other downstream 1472198 45605280 ~ 45605396 (+) True XLOC_032300
TCONS_00063065 other downstream 1799159 45932241 ~ 45933222 (+) False XLOC_032302
TCONS_00063069 other downstream 1892764 46025846 ~ 46025963 (+) True XLOC_032304
TCONS_00063090 other downstream 2616424 46749506 ~ 46749624 (+) True XLOC_032314