RNA id: TCONS_00063059


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00063059
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_032298
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 45355409 ~ 45355525 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TACCACAGCTTTATCACCAAGCAGCACAAGAcctgttactcactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtaccggATGGGCAATGACATGGTGAAAACTAGATTGCTGTTAGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177199

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064949 lncRNA upstream 272120 44987628 ~ 45083289 (+) False XLOC_032295
TCONS_00064950 lncRNA upstream 272120 44987683 ~ 45083289 (+) True XLOC_032295
TCONS_00064682 lncRNA upstream 338572 44987628 ~ 45016837 (+) False XLOC_032295
TCONS_00064947 lncRNA upstream 549821 44400764 ~ 44805588 (+) False XLOC_032292
TCONS_00064681 lncRNA upstream 557850 44721192 ~ 44797559 (+) True XLOC_032293
TCONS_00063063 lncRNA downstream 563456 45918981 ~ 45922790 (+) False XLOC_032301
TCONS_00063068 lncRNA downstream 579242 45934767 ~ 45936653 (+) True XLOC_032303
TCONS_00063070 lncRNA downstream 903295 46258820 ~ 46262122 (+) False XLOC_032305
TCONS_00063073 lncRNA downstream 954211 46309736 ~ 46320528 (+) True XLOC_032306
TCONS_00063081 lncRNA downstream 1065594 46421119 ~ 46425712 (+) False XLOC_032309
TCONS_00063056 mRNA upstream 26499 45300746 ~ 45328910 (+) True XLOC_032296
TCONS_00063055 mRNA upstream 26710 45114674 ~ 45328699 (+) False XLOC_032296
TCONS_00063054 mRNA upstream 27928 45114613 ~ 45327481 (+) False XLOC_032296
TCONS_00063051 mRNA upstream 377981 44812444 ~ 44977428 (+) False XLOC_032294
TCONS_00063052 mRNA upstream 377981 44812444 ~ 44977428 (+) False XLOC_032294
TCONS_00063060 mRNA downstream 138702 45494227 ~ 45838086 (+) False XLOC_032299
TCONS_00063062 mRNA downstream 336501 45692026 ~ 45838103 (+) True XLOC_032299
TCONS_00063064 mRNA downstream 563456 45918981 ~ 45929465 (+) True XLOC_032301
TCONS_00063066 mRNA downstream 576751 45932276 ~ 45933368 (+) True XLOC_032302
TCONS_00063067 mRNA downstream 579157 45934682 ~ 45937000 (+) False XLOC_032303
TCONS_00063044 other upstream 1222327 44132968 ~ 44133082 (+) True XLOC_032289
TCONS_00063042 other upstream 1853130 43499071 ~ 43502279 (+) True XLOC_032286
TCONS_00063027 other upstream 2674799 42674613 ~ 42680610 (+) True XLOC_032276
TCONS_00063023 other upstream 2701984 42646411 ~ 42653425 (+) True XLOC_032274
TCONS_00063022 other upstream 2712376 42635960 ~ 42643033 (+) True XLOC_032273
TCONS_00063061 other downstream 249755 45605280 ~ 45605396 (+) True XLOC_032300
TCONS_00063065 other downstream 576716 45932241 ~ 45933222 (+) False XLOC_032302
TCONS_00063069 other downstream 670321 46025846 ~ 46025963 (+) True XLOC_032304
TCONS_00063090 other downstream 1393981 46749506 ~ 46749624 (+) True XLOC_032314
TCONS_00063091 other downstream 1514659 46870184 ~ 46870298 (+) True XLOC_032316