RNA id: TCONS_00063061



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00063061
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_032300
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 45605280 ~ 45605396 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccggcagctagctctctgaaaCTCTCACATAgtcgctcactgaagctaagcagggctgagtctggtcagtagctggataggagaccacatggaaaagctataGGTTGCTGCCGGAT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178009

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064949 lncRNA upstream 521991 44987628 ~ 45083289 (+) False XLOC_032295
TCONS_00064950 lncRNA upstream 521991 44987683 ~ 45083289 (+) True XLOC_032295
TCONS_00064682 lncRNA upstream 588443 44987628 ~ 45016837 (+) False XLOC_032295
TCONS_00064681 lncRNA upstream 807721 44721192 ~ 44797559 (+) True XLOC_032293
TCONS_00064948 lncRNA upstream 884776 44486080 ~ 44720504 (+) True XLOC_032292
TCONS_00063063 lncRNA downstream 313585 45918981 ~ 45922790 (+) False XLOC_032301
TCONS_00063068 lncRNA downstream 329371 45934767 ~ 45936653 (+) True XLOC_032303
TCONS_00063070 lncRNA downstream 653424 46258820 ~ 46262122 (+) False XLOC_032305
TCONS_00063073 lncRNA downstream 704340 46309736 ~ 46320528 (+) True XLOC_032306
TCONS_00063081 lncRNA downstream 815723 46421119 ~ 46425712 (+) False XLOC_032309
TCONS_00063057 mRNA upstream 228522 45346808 ~ 45376758 (+) False XLOC_032297
TCONS_00063058 mRNA upstream 228522 45347219 ~ 45376758 (+) True XLOC_032297
TCONS_00063056 mRNA upstream 276370 45300746 ~ 45328910 (+) True XLOC_032296
TCONS_00063055 mRNA upstream 276581 45114674 ~ 45328699 (+) False XLOC_032296
TCONS_00063054 mRNA upstream 277799 45114613 ~ 45327481 (+) False XLOC_032296
TCONS_00063062 mRNA downstream 86630 45692026 ~ 45838103 (+) True XLOC_032299
TCONS_00063064 mRNA downstream 313585 45918981 ~ 45929465 (+) True XLOC_032301
TCONS_00063066 mRNA downstream 326880 45932276 ~ 45933368 (+) True XLOC_032302
TCONS_00063067 mRNA downstream 329286 45934682 ~ 45937000 (+) False XLOC_032303
TCONS_00063071 mRNA downstream 653470 46258866 ~ 46309060 (+) False XLOC_032305
TCONS_00063059 other upstream 249755 45355409 ~ 45355525 (+) True XLOC_032298
TCONS_00063044 other upstream 1472198 44132968 ~ 44133082 (+) True XLOC_032289
TCONS_00063042 other upstream 2103001 43499071 ~ 43502279 (+) True XLOC_032286
TCONS_00063027 other upstream 2924670 42674613 ~ 42680610 (+) True XLOC_032276
TCONS_00063023 other upstream 2951855 42646411 ~ 42653425 (+) True XLOC_032274
TCONS_00063065 other downstream 326845 45932241 ~ 45933222 (+) False XLOC_032302
TCONS_00063069 other downstream 420450 46025846 ~ 46025963 (+) True XLOC_032304
TCONS_00063090 other downstream 1144110 46749506 ~ 46749624 (+) True XLOC_032314
TCONS_00063091 other downstream 1264788 46870184 ~ 46870298 (+) True XLOC_032316
TCONS_00063092 other downstream 1672743 47278139 ~ 47278257 (+) True XLOC_032318