RNA id: TCONS_00063730



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00063730
length 98
RNA type miRNA
GC content 0.60
exon number 1
gene id XLOC_032745
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 17114658 ~ 17114755 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


caggttttctggtttgacgtcccggtgcaggacgccgcggctctcgcagtgttttagggcctcgatcagctgcaccagcactttcttggccagacgct

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000189896

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00063728 lncRNA downstream 13303 17099672 ~ 17101355 (-) True XLOC_032743
TCONS_00063725 lncRNA downstream 80365 17032975 ~ 17034293 (-) True XLOC_032740
TCONS_00065118 lncRNA downstream 186721 16927535 ~ 16927937 (-) True XLOC_032735
TCONS_00065117 lncRNA downstream 188424 16925838 ~ 16926234 (-) True XLOC_032734
TCONS_00065116 lncRNA downstream 195154 16918388 ~ 16919504 (-) True XLOC_032733
TCONS_00063731 lncRNA upstream 4524 17119279 ~ 17217521 (-) True XLOC_032746
TCONS_00065119 lncRNA upstream 40148 17154903 ~ 17155299 (-) True XLOC_032747
TCONS_00065120 lncRNA upstream 41859 17156614 ~ 17157202 (-) True XLOC_032748
TCONS_00065121 lncRNA upstream 84889 17199644 ~ 17204841 (-) False XLOC_032751
TCONS_00063738 lncRNA upstream 167152 17281907 ~ 17285849 (-) True XLOC_032755
TCONS_00063729 mRNA downstream 2507 17110835 ~ 17112151 (-) True XLOC_032744
TCONS_00063726 mRNA downstream 62542 17050800 ~ 17052116 (-) True XLOC_032741
TCONS_00063723 mRNA downstream 133337 16980025 ~ 16981321 (-) True XLOC_032738
TCONS_00063721 mRNA downstream 166618 16946724 ~ 16948040 (-) True XLOC_032736
TCONS_00063719 mRNA downstream 220346 16893171 ~ 16894312 (-) True XLOC_032730
TCONS_00063732 mRNA upstream 63566 17178321 ~ 17179637 (-) True XLOC_032749
TCONS_00063734 mRNA upstream 90030 17204785 ~ 17206028 (-) True XLOC_032751
TCONS_00063736 mRNA upstream 150150 17264905 ~ 17266221 (-) True XLOC_032753
TCONS_00063743 mRNA upstream 611033 17725788 ~ 17849786 (-) False XLOC_032763
TCONS_00063746 mRNA upstream 612775 17727530 ~ 17999776 (-) False XLOC_032763
TCONS_00063727 other downstream 59931 17054631 ~ 17054727 (-) True XLOC_032742
TCONS_00063724 other downstream 130972 16983589 ~ 16983686 (-) True XLOC_032739
TCONS_00063722 other downstream 164066 16950495 ~ 16950592 (-) True XLOC_032737
TCONS_00063720 other downstream 217584 16896978 ~ 16897074 (-) True XLOC_032731
TCONS_00063718 other downstream 243255 16871306 ~ 16871403 (-) True XLOC_032729
TCONS_00063733 other upstream 67383 17182138 ~ 17182235 (-) True XLOC_032750
TCONS_00063735 other upstream 94006 17208761 ~ 17208858 (-) True XLOC_032752
TCONS_00063737 other upstream 153907 17268662 ~ 17268759 (-) True XLOC_032754
TCONS_00063739 other upstream 240313 17355068 ~ 17355165 (-) True XLOC_032756
TCONS_00063740 other upstream 270277 17385032 ~ 17385129 (-) True XLOC_032757