RNA id: TCONS_00063740


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00063740
length 98
RNA type miRNA
GC content 0.59
exon number 1
gene id XLOC_032757
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 17385032 ~ 17385129 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

caggtttTCTGGTTTGACGTCCCGATGCAGGACGCCacggctctcgcagtgttttagggccgcgatcagctgcaccagcactttcttggccagacgct

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000193075

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00063738 lncRNA downstream 99183 17281907 ~ 17285849 (-) True XLOC_032755
TCONS_00063731 lncRNA downstream 167511 17119279 ~ 17217521 (-) True XLOC_032746
TCONS_00065122 lncRNA upstream 149831 17534960 ~ 17535475 (-) True XLOC_032760
TCONS_00065123 lncRNA upstream 282387 17667516 ~ 17668826 (-) True XLOC_032761
TCONS_00065124 lncRNA upstream 291063 17676192 ~ 17676959 (-) True XLOC_032762
TCONS_00063747 lncRNA upstream 587112 17972241 ~ 17999665 (-) False XLOC_032763
TCONS_00063748 lncRNA upstream 594911 17980040 ~ 17999751 (-) False XLOC_032763
TCONS_00063736 mRNA downstream 118811 17264905 ~ 17266221 (-) True XLOC_032753
TCONS_00063734 mRNA downstream 179004 17204785 ~ 17206028 (-) True XLOC_032751
TCONS_00063732 mRNA downstream 205395 17178321 ~ 17179637 (-) True XLOC_032749
TCONS_00063729 mRNA downstream 272881 17110835 ~ 17112151 (-) True XLOC_032744
TCONS_00063726 mRNA downstream 332916 17050800 ~ 17052116 (-) True XLOC_032741
TCONS_00063743 mRNA upstream 340659 17725788 ~ 17849786 (-) False XLOC_032763
TCONS_00063746 mRNA upstream 342401 17727530 ~ 17999776 (-) False XLOC_032763
TCONS_00063745 mRNA upstream 342401 17727530 ~ 17999776 (-) False XLOC_032763
TCONS_00063744 mRNA upstream 342401 17727530 ~ 17999776 (-) False XLOC_032763
TCONS_00063749 mRNA upstream 689392 18074521 ~ 18121075 (-) False XLOC_032765
TCONS_00063739 other downstream 29867 17355068 ~ 17355165 (-) True XLOC_032756
TCONS_00063737 other downstream 116273 17268662 ~ 17268759 (-) True XLOC_032754
TCONS_00063735 other downstream 176174 17208761 ~ 17208858 (-) True XLOC_032752
TCONS_00063733 other downstream 202797 17182138 ~ 17182235 (-) True XLOC_032750
TCONS_00063730 other downstream 270277 17114658 ~ 17114755 (-) True XLOC_032745
TCONS_00063741 other upstream 74172 17459301 ~ 17459398 (-) True XLOC_032758
TCONS_00063742 other upstream 130646 17515775 ~ 17515872 (-) True XLOC_032759
TCONS_00063755 other upstream 881467 18266596 ~ 18267362 (-) True XLOC_032769
TCONS_00063763 other upstream 1131182 18516311 ~ 18516407 (-) True XLOC_032773
TCONS_00063764 other upstream 1132841 18517970 ~ 18518067 (-) True XLOC_032774