RNA id: TCONS_00063764


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00063764
length 98
RNA type miRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_032774
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 18517970 ~ 18518067 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GAGAGTGTGTCAGAGGCTGGGTCTTTGCGGGCAAGGTGAGTTTTCCTTTCATTCAACTGGCCTACAAAGTCCCAGTTTTCGGCCCATGTGACCATCTC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000169501

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00063760 lncRNA downstream 127800 18389169 ~ 18390170 (-) False XLOC_032772
TCONS_00065129 lncRNA downstream 195306 18289836 ~ 18322664 (-) False XLOC_032770
TCONS_00063756 lncRNA downstream 225924 18290802 ~ 18292046 (-) True XLOC_032770
TCONS_00065128 lncRNA downstream 448406 18066594 ~ 18069564 (-) True XLOC_032764
TCONS_00065127 lncRNA downstream 448449 18066594 ~ 18069521 (-) False XLOC_032764
TCONS_00063766 lncRNA upstream 11319 18529386 ~ 18530929 (-) False XLOC_032775
TCONS_00063769 lncRNA upstream 12300 18530367 ~ 18531250 (-) True XLOC_032775
TCONS_00063771 lncRNA upstream 39354 18557421 ~ 18560200 (-) False XLOC_032776
TCONS_00064724 lncRNA upstream 921033 19439100 ~ 19440159 (-) True XLOC_032793
TCONS_00063812 lncRNA upstream 1153612 19671679 ~ 19672339 (-) True XLOC_032795
TCONS_00063759 mRNA downstream 117347 18388327 ~ 18400623 (-) False XLOC_032772
TCONS_00063761 mRNA downstream 117422 18389388 ~ 18400548 (-) False XLOC_032772
TCONS_00063762 mRNA downstream 124494 18389497 ~ 18393476 (-) True XLOC_032772
TCONS_00063758 mRNA downstream 151631 18364325 ~ 18366339 (-) True XLOC_032771
TCONS_00063757 mRNA downstream 151683 18364048 ~ 18366287 (-) False XLOC_032771
TCONS_00063765 mRNA upstream 6377 18524444 ~ 18531386 (-) False XLOC_032775
TCONS_00063767 mRNA upstream 11381 18529448 ~ 18531349 (-) False XLOC_032775
TCONS_00063768 mRNA upstream 12016 18530083 ~ 18531760 (-) False XLOC_032775
TCONS_00063770 mRNA upstream 36752 18554819 ~ 18560190 (-) False XLOC_032776
TCONS_00063773 mRNA upstream 76910 18594977 ~ 18601304 (-) True XLOC_032777
TCONS_00063763 other downstream 1563 18516311 ~ 18516407 (-) True XLOC_032773
TCONS_00063755 other downstream 250608 18266596 ~ 18267362 (-) True XLOC_032769
TCONS_00063742 other downstream 1002098 17515775 ~ 17515872 (-) True XLOC_032759
TCONS_00063741 other downstream 1058572 17459301 ~ 17459398 (-) True XLOC_032758
TCONS_00063740 other downstream 1132841 17385032 ~ 17385129 (-) True XLOC_032757
TCONS_00063772 other upstream 39762 18557829 ~ 18560135 (-) True XLOC_032776
TCONS_00063790 other upstream 619774 19137841 ~ 19138634 (-) True XLOC_032783
TCONS_00063791 other upstream 628357 19146424 ~ 19147218 (-) True XLOC_032784
TCONS_00063797 other upstream 748150 19266217 ~ 19271143 (-) True XLOC_032786
TCONS_00063808 other upstream 874793 19392860 ~ 19392977 (-) True XLOC_032792