RNA id: TCONS_00063817


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00063817
length 98
RNA type miRNA
GC content 0.60
exon number 1
gene id XLOC_032799
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 20178436 ~ 20178533 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

caggttttctggtttgacgtcccgatgcaggacgccgcggctctcgcagtgttttagggccgcgatcagctgcaccagcactttcttggccagacgct

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000190529

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00063812 lncRNA downstream 506097 19671679 ~ 19672339 (-) True XLOC_032795
TCONS_00064724 lncRNA downstream 738277 19439100 ~ 19440159 (-) True XLOC_032793
TCONS_00063771 lncRNA downstream 1618236 18557421 ~ 18560200 (-) False XLOC_032776
TCONS_00063769 lncRNA downstream 1647186 18530367 ~ 18531250 (-) True XLOC_032775
TCONS_00063766 lncRNA downstream 1647507 18529386 ~ 18530929 (-) False XLOC_032775
TCONS_00065130 lncRNA upstream 22795 20201328 ~ 20202082 (-) False XLOC_032800
TCONS_00063818 lncRNA upstream 23476 20202009 ~ 20288898 (-) False XLOC_032800
TCONS_00063819 lncRNA upstream 23476 20202009 ~ 20360733 (-) False XLOC_032800
TCONS_00065131 lncRNA upstream 46904 20225437 ~ 20226644 (-) True XLOC_032801
TCONS_00065132 lncRNA upstream 105756 20284289 ~ 20284659 (-) False XLOC_032802
TCONS_00063814 mRNA downstream 251779 19804048 ~ 19926657 (-) False XLOC_032797
TCONS_00063815 mRNA downstream 251779 19845979 ~ 19926657 (-) True XLOC_032797
TCONS_00063811 mRNA downstream 495030 19667619 ~ 19683406 (-) False XLOC_032795
TCONS_00063810 mRNA downstream 513322 19481394 ~ 19665114 (-) True XLOC_032794
TCONS_00063809 mRNA downstream 513588 19481394 ~ 19664848 (-) False XLOC_032794
TCONS_00063826 mRNA upstream 500357 20678890 ~ 20707846 (-) True XLOC_032821
TCONS_00063828 mRNA upstream 586315 20764848 ~ 20875111 (-) False XLOC_032822
TCONS_00063827 mRNA upstream 586315 20764848 ~ 20875111 (-) False XLOC_032822
TCONS_00063829 mRNA upstream 743009 20921542 ~ 20952187 (-) True XLOC_032823
TCONS_00063830 mRNA upstream 890250 21068783 ~ 21091948 (-) True XLOC_032826
TCONS_00063816 other downstream 42280 20136059 ~ 20136156 (-) True XLOC_032798
TCONS_00063813 other downstream 461895 19716423 ~ 19716541 (-) True XLOC_032796
TCONS_00063808 other downstream 785459 19392860 ~ 19392977 (-) True XLOC_032792
TCONS_00063797 other downstream 907293 19266217 ~ 19271143 (-) True XLOC_032786
TCONS_00063791 other downstream 1031218 19146424 ~ 19147218 (-) True XLOC_032784
TCONS_00063821 other upstream 121018 20299551 ~ 20299648 (-) True XLOC_032803
TCONS_00063822 other upstream 158611 20337144 ~ 20337241 (-) True XLOC_032806
TCONS_00063823 other upstream 231024 20409557 ~ 20409654 (-) True XLOC_032810
TCONS_00063824 other upstream 285869 20464402 ~ 20464499 (-) True XLOC_032814
TCONS_00063825 other upstream 468694 20647227 ~ 20647333 (-) True XLOC_032820