RNA id: TCONS_00063821


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00063821
length 98
RNA type miRNA
GC content 0.60
exon number 1
gene id XLOC_032803
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 20299551 ~ 20299648 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

caggttttctggtttgacgtcccggtgcaggacgccgcggctctcgcagtgttttagggccgcaatcagctgcaccagcactttcttggccagacgct

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000180870

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00063818 lncRNA downstream 10653 20202009 ~ 20288898 (-) False XLOC_032800
TCONS_00065133 lncRNA downstream 11138 20287774 ~ 20288413 (-) True XLOC_032800
TCONS_00065132 lncRNA downstream 14892 20284289 ~ 20284659 (-) False XLOC_032802
TCONS_00065131 lncRNA downstream 72907 20225437 ~ 20226644 (-) True XLOC_032801
TCONS_00065130 lncRNA downstream 97469 20201328 ~ 20202082 (-) False XLOC_032800
TCONS_00064726 lncRNA upstream 14643 20314291 ~ 20316167 (-) False XLOC_032804
TCONS_00064725 lncRNA upstream 14643 20314291 ~ 20316167 (-) True XLOC_032804
TCONS_00065134 lncRNA upstream 28161 20327809 ~ 20332996 (-) True XLOC_032805
TCONS_00065135 lncRNA upstream 59874 20359522 ~ 20360276 (-) True XLOC_032807
TCONS_00065136 lncRNA upstream 82805 20382453 ~ 20382910 (-) True XLOC_032808
TCONS_00063814 mRNA downstream 372894 19804048 ~ 19926657 (-) False XLOC_032797
TCONS_00063815 mRNA downstream 372894 19845979 ~ 19926657 (-) True XLOC_032797
TCONS_00063811 mRNA downstream 616145 19667619 ~ 19683406 (-) False XLOC_032795
TCONS_00063810 mRNA downstream 634437 19481394 ~ 19665114 (-) True XLOC_032794
TCONS_00063809 mRNA downstream 634703 19481394 ~ 19664848 (-) False XLOC_032794
TCONS_00063826 mRNA upstream 379242 20678890 ~ 20707846 (-) True XLOC_032821
TCONS_00063828 mRNA upstream 465200 20764848 ~ 20875111 (-) False XLOC_032822
TCONS_00063827 mRNA upstream 465200 20764848 ~ 20875111 (-) False XLOC_032822
TCONS_00063829 mRNA upstream 621894 20921542 ~ 20952187 (-) True XLOC_032823
TCONS_00063830 mRNA upstream 769135 21068783 ~ 21091948 (-) True XLOC_032826
TCONS_00063817 other downstream 121018 20178436 ~ 20178533 (-) True XLOC_032799
TCONS_00063816 other downstream 163395 20136059 ~ 20136156 (-) True XLOC_032798
TCONS_00063813 other downstream 583010 19716423 ~ 19716541 (-) True XLOC_032796
TCONS_00063808 other downstream 906574 19392860 ~ 19392977 (-) True XLOC_032792
TCONS_00063797 other downstream 1028408 19266217 ~ 19271143 (-) True XLOC_032786
TCONS_00063822 other upstream 37496 20337144 ~ 20337241 (-) True XLOC_032806
TCONS_00063823 other upstream 109909 20409557 ~ 20409654 (-) True XLOC_032810
TCONS_00063824 other upstream 164754 20464402 ~ 20464499 (-) True XLOC_032814
TCONS_00063825 other upstream 347579 20647227 ~ 20647333 (-) True XLOC_032820
TCONS_00063850 other upstream 2241334 22540982 ~ 22541076 (-) True XLOC_032844