RNA id: TCONS_00064728


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064728
length 392
lncRNA type sense_over
GC content 0.46
exon number 2
gene id XLOC_032822
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 20764848 ~ 20875111 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TCTGTTTAATGAACTGGACAAAATGATATTTTTCCAAAGACACAGAGACTGGCAAAGTCTCTGGTGAACAGTGCTGAATACAGTACTTGGAATCAAAACTGAATTTGAGTTTACATCGGGCCTCAAAATAGATGCTGCTCATACTCAAGGTCCAATAGACGGCAATCTGTACGCCCGGGTTCAAAAGAAAAACTCTCTTGAGGGTATTGTGCCAGCCAATGGTGCTTATTCAACTGACCGTGTTCCTCCTGTAGCTGAACACGCTCTTCCTCTTCCAGTTGCCAACCATCAGCTACCAGCTGCAGACCACGCTCTTTCTGTCAGCAGTGACTCAGGCAACTCCACCGCTTCCGTTAAGACAGACCGCACAGATGATGCTCAACAATCTCTGT

Function

GO:

id name namespace
GO:0035556 intracellular signal transduction biological_process
GO:0046872 metal ion binding molecular_function

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064727 lncRNA downstream 176696 20612358 ~ 20613182 (-) True XLOC_032819
TCONS_00065145 lncRNA downstream 177452 20610192 ~ 20612426 (-) False XLOC_032819
TCONS_00065144 lncRNA downstream 225759 20563033 ~ 20564119 (-) True XLOC_032818
TCONS_00065143 lncRNA downstream 251709 20537799 ~ 20538169 (-) True XLOC_032817
TCONS_00065142 lncRNA downstream 296500 20492143 ~ 20493378 (-) True XLOC_032816
TCONS_00064729 lncRNA upstream 21089 20814723 ~ 20822120 (-) False XLOC_032822
TCONS_00065146 lncRNA upstream 21089 20814723 ~ 20874343 (-) False XLOC_032822
TCONS_00064730 lncRNA upstream 23874 20817508 ~ 20874343 (-) True XLOC_032822
TCONS_00064731 lncRNA upstream 218972 21012606 ~ 21013047 (-) True XLOC_032824
TCONS_00064732 lncRNA upstream 236807 21030441 ~ 21030708 (-) True XLOC_032825
TCONS_00063826 mRNA downstream 82032 20678890 ~ 20707846 (-) True XLOC_032821
TCONS_00063814 mRNA downstream 863221 19804048 ~ 19926657 (-) False XLOC_032797
TCONS_00063815 mRNA downstream 863221 19845979 ~ 19926657 (-) True XLOC_032797
TCONS_00063811 mRNA downstream 1106472 19667619 ~ 19683406 (-) False XLOC_032795
TCONS_00063810 mRNA downstream 1124764 19481394 ~ 19665114 (-) True XLOC_032794
TCONS_00063829 mRNA upstream 127908 20921542 ~ 20952187 (-) True XLOC_032823
TCONS_00063830 mRNA upstream 275149 21068783 ~ 21091948 (-) True XLOC_032826
TCONS_00063831 mRNA upstream 363561 21157195 ~ 21189295 (-) True XLOC_032827
TCONS_00063833 mRNA upstream 676627 21470261 ~ 21492752 (-) False XLOC_032828
TCONS_00063832 mRNA upstream 676627 21470261 ~ 21492752 (-) True XLOC_032828
TCONS_00063825 other downstream 142545 20647227 ~ 20647333 (-) True XLOC_032820
TCONS_00063824 other downstream 325379 20464402 ~ 20464499 (-) True XLOC_032814
TCONS_00063823 other downstream 380224 20409557 ~ 20409654 (-) True XLOC_032810
TCONS_00063822 other downstream 452637 20337144 ~ 20337241 (-) True XLOC_032806
TCONS_00063821 other downstream 490230 20299551 ~ 20299648 (-) True XLOC_032803
TCONS_00063850 other upstream 1747348 22540982 ~ 22541076 (-) True XLOC_032844
TCONS_00063855 other upstream 2601209 23394843 ~ 23394899 (-) True XLOC_032849
TCONS_00063859 other upstream 3161740 23955374 ~ 24053616 (-) False XLOC_032853
TCONS_00063876 other upstream 3992193 24785827 ~ 24785943 (-) True XLOC_032864
TCONS_00063877 other upstream 4048536 24842170 ~ 24842286 (-) True XLOC_032865

Expression Profile

//