RNA id: TCONS_00064732


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064732
length 268
lncRNA type inter_gene
GC content 0.47
exon number 1
gene id XLOC_032825
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 21030441 ~ 21030708 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GACCTGCATCTCAGGGCACTGACTTCAGAAGAAGAGAAAATCTCTTTTGTAGACCTTGGGTGGAACAACTGGTTTGTTCATCCTAAATTGTTCACCTTCTACTACTGCTTTGTCAACTGCAGTCCAGCAGTCACCATCATTCTTGGGATCACCCAGTGCTGCGCTCCTGTTCCAGAGCATGAAGTCACTCCGTTTCACCACCACCTCAGATGGGGGATACTCATTCAAATATGAGACCCTGCCTAACATCATACCAGAAGAGTGCAAC

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064731 lncRNA downstream 17394 21012606 ~ 21013047 (-) True XLOC_032824
TCONS_00065146 lncRNA downstream 156098 20814723 ~ 20874343 (-) False XLOC_032822
TCONS_00064730 lncRNA downstream 156098 20817508 ~ 20874343 (-) True XLOC_032822
TCONS_00064729 lncRNA downstream 208321 20814723 ~ 20822120 (-) False XLOC_032822
TCONS_00064728 lncRNA downstream 236807 20789878 ~ 20793634 (-) False XLOC_032822
TCONS_00064733 lncRNA upstream 465771 21496479 ~ 21498035 (-) True XLOC_032829
TCONS_00064734 lncRNA upstream 473795 21504503 ~ 21508878 (-) False XLOC_032830
TCONS_00065147 lncRNA upstream 476185 21506893 ~ 21509039 (-) True XLOC_032830
TCONS_00064735 lncRNA upstream 501597 21532305 ~ 21534232 (-) True XLOC_032832
TCONS_00064736 lncRNA upstream 547152 21577860 ~ 21582638 (-) True XLOC_032833
TCONS_00063829 mRNA downstream 78254 20921542 ~ 20952187 (-) True XLOC_032823
TCONS_00063828 mRNA downstream 155330 20764848 ~ 20875111 (-) False XLOC_032822
TCONS_00063827 mRNA downstream 155330 20764848 ~ 20875111 (-) False XLOC_032822
TCONS_00063826 mRNA downstream 322595 20678890 ~ 20707846 (-) True XLOC_032821
TCONS_00063815 mRNA downstream 1103784 19845979 ~ 19926657 (-) True XLOC_032797
TCONS_00063830 mRNA upstream 38075 21068783 ~ 21091948 (-) True XLOC_032826
TCONS_00063831 mRNA upstream 126487 21157195 ~ 21189295 (-) True XLOC_032827
TCONS_00063833 mRNA upstream 439553 21470261 ~ 21492752 (-) False XLOC_032828
TCONS_00063832 mRNA upstream 439553 21470261 ~ 21492752 (-) True XLOC_032828
TCONS_00063834 mRNA upstream 482655 21513363 ~ 21521755 (-) True XLOC_032831
TCONS_00063825 other downstream 383108 20647227 ~ 20647333 (-) True XLOC_032820
TCONS_00063824 other downstream 565942 20464402 ~ 20464499 (-) True XLOC_032814
TCONS_00063823 other downstream 620787 20409557 ~ 20409654 (-) True XLOC_032810
TCONS_00063822 other downstream 693200 20337144 ~ 20337241 (-) True XLOC_032806
TCONS_00063821 other downstream 730793 20299551 ~ 20299648 (-) True XLOC_032803
TCONS_00063850 other upstream 1510274 22540982 ~ 22541076 (-) True XLOC_032844
TCONS_00063855 other upstream 2364135 23394843 ~ 23394899 (-) True XLOC_032849
TCONS_00063859 other upstream 2924666 23955374 ~ 24053616 (-) False XLOC_032853
TCONS_00063876 other upstream 3755119 24785827 ~ 24785943 (-) True XLOC_032864
TCONS_00063877 other upstream 3811462 24842170 ~ 24842286 (-) True XLOC_032865