RNA id: TCONS_00063876



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00063876
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_032864
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 24785827 ~ 24785943 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ttccatggtcatatcaccctgcagcctaagaccggttactcactgaagctaagcagggctgagcctggtcattaTCTAGATGGGCCAGCACattggaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175552

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00063875 lncRNA downstream 401242 24381611 ~ 24384585 (-) True XLOC_032863
TCONS_00064744 lncRNA downstream 566650 24217928 ~ 24219177 (-) True XLOC_032859
TCONS_00064743 lncRNA downstream 1364089 23420169 ~ 23421738 (-) True XLOC_032850
TCONS_00065149 lncRNA downstream 1571033 23210551 ~ 23214794 (-) True XLOC_032848
TCONS_00064742 lncRNA downstream 1571541 23210551 ~ 23214286 (-) False XLOC_032848
TCONS_00065150 lncRNA upstream 64150 24850093 ~ 24869146 (-) True XLOC_032866
TCONS_00063881 lncRNA upstream 376033 25161976 ~ 25165665 (-) True XLOC_032868
TCONS_00065151 lncRNA upstream 482008 25267951 ~ 25268308 (-) True XLOC_032872
TCONS_00065152 lncRNA upstream 1504840 26290783 ~ 26309847 (-) True XLOC_032876
TCONS_00065154 lncRNA upstream 1776038 26561981 ~ 26674943 (-) False XLOC_032878
TCONS_00063873 mRNA downstream 392912 24364678 ~ 24392915 (-) False XLOC_032863
TCONS_00063872 mRNA downstream 392918 24364678 ~ 24392909 (-) False XLOC_032863
TCONS_00063871 mRNA downstream 393401 24364678 ~ 24392426 (-) False XLOC_032863
TCONS_00063874 mRNA downstream 401173 24370652 ~ 24384654 (-) False XLOC_032863
TCONS_00063870 mRNA downstream 427095 24329275 ~ 24358732 (-) True XLOC_032862
TCONS_00063878 mRNA upstream 359322 25145265 ~ 25155086 (-) True XLOC_032867
TCONS_00063879 mRNA upstream 371388 25157331 ~ 25163722 (-) False XLOC_032868
TCONS_00063880 mRNA upstream 371765 25157708 ~ 25165693 (-) False XLOC_032868
TCONS_00063882 mRNA upstream 381307 25167250 ~ 25189739 (-) False XLOC_032869
TCONS_00063883 mRNA upstream 385365 25171308 ~ 25181012 (-) False XLOC_032869
TCONS_00063859 other downstream 732211 23955374 ~ 24053616 (-) False XLOC_032853
TCONS_00063855 other downstream 1390928 23394843 ~ 23394899 (-) True XLOC_032849
TCONS_00063850 other downstream 2244751 22540982 ~ 22541076 (-) True XLOC_032844
TCONS_00063825 other downstream 4138494 20647227 ~ 20647333 (-) True XLOC_032820
TCONS_00063824 other downstream 4321328 20464402 ~ 20464499 (-) True XLOC_032814
TCONS_00063877 other upstream 56227 24842170 ~ 24842286 (-) True XLOC_032865
TCONS_00063885 other upstream 402080 25188023 ~ 25188783 (-) True XLOC_032870
TCONS_00063901 other upstream 2255804 27041747 ~ 27048982 (-) False XLOC_032882
TCONS_00063903 other upstream 2265399 27051342 ~ 27055863 (-) True XLOC_032882
TCONS_00063923 other upstream 4225968 29011911 ~ 29084554 (-) False XLOC_032900