RNA id: TCONS_00063877


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00063877
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_032865
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 24842170 ~ 24842286 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AGCCACAACCACATCACCCGGCAggccaagaccggttactcacagAAGCTAGGCAGGATGGAGCCTGGTCAATAGATGtacgggagaccacatgggaaaacttggTTGCTGATGTGT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000174727

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00063875 lncRNA downstream 457585 24381611 ~ 24384585 (-) True XLOC_032863
TCONS_00064744 lncRNA downstream 622993 24217928 ~ 24219177 (-) True XLOC_032859
TCONS_00064743 lncRNA downstream 1420432 23420169 ~ 23421738 (-) True XLOC_032850
TCONS_00065149 lncRNA downstream 1627376 23210551 ~ 23214794 (-) True XLOC_032848
TCONS_00064742 lncRNA downstream 1627884 23210551 ~ 23214286 (-) False XLOC_032848
TCONS_00065150 lncRNA upstream 7807 24850093 ~ 24869146 (-) True XLOC_032866
TCONS_00063881 lncRNA upstream 319690 25161976 ~ 25165665 (-) True XLOC_032868
TCONS_00065151 lncRNA upstream 425665 25267951 ~ 25268308 (-) True XLOC_032872
TCONS_00065152 lncRNA upstream 1448497 26290783 ~ 26309847 (-) True XLOC_032876
TCONS_00065154 lncRNA upstream 1719695 26561981 ~ 26674943 (-) False XLOC_032878
TCONS_00063873 mRNA downstream 449255 24364678 ~ 24392915 (-) False XLOC_032863
TCONS_00063872 mRNA downstream 449261 24364678 ~ 24392909 (-) False XLOC_032863
TCONS_00063871 mRNA downstream 449744 24364678 ~ 24392426 (-) False XLOC_032863
TCONS_00063874 mRNA downstream 457516 24370652 ~ 24384654 (-) False XLOC_032863
TCONS_00063870 mRNA downstream 483438 24329275 ~ 24358732 (-) True XLOC_032862
TCONS_00063878 mRNA upstream 302979 25145265 ~ 25155086 (-) True XLOC_032867
TCONS_00063879 mRNA upstream 315045 25157331 ~ 25163722 (-) False XLOC_032868
TCONS_00063880 mRNA upstream 315422 25157708 ~ 25165693 (-) False XLOC_032868
TCONS_00063882 mRNA upstream 324964 25167250 ~ 25189739 (-) False XLOC_032869
TCONS_00063883 mRNA upstream 329022 25171308 ~ 25181012 (-) False XLOC_032869
TCONS_00063876 other downstream 56227 24785827 ~ 24785943 (-) True XLOC_032864
TCONS_00063859 other downstream 788554 23955374 ~ 24053616 (-) False XLOC_032853
TCONS_00063855 other downstream 1447271 23394843 ~ 23394899 (-) True XLOC_032849
TCONS_00063850 other downstream 2301094 22540982 ~ 22541076 (-) True XLOC_032844
TCONS_00063825 other downstream 4194837 20647227 ~ 20647333 (-) True XLOC_032820
TCONS_00063885 other upstream 345737 25188023 ~ 25188783 (-) True XLOC_032870
TCONS_00063901 other upstream 2199461 27041747 ~ 27048982 (-) False XLOC_032882
TCONS_00063903 other upstream 2209056 27051342 ~ 27055863 (-) True XLOC_032882
TCONS_00063923 other upstream 4169625 29011911 ~ 29084554 (-) False XLOC_032900
TCONS_00063930 other upstream 4202711 29044997 ~ 29052872 (-) False XLOC_032900