RNA id: TCONS_00063952


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00063952
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_032918
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 30202921 ~ 30203037 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tgCCACAGTCATATCACCCAGCAGCCTAAGACCGGTTACtccctgaagctaagcagggttgagcctggtcagtacctggatgggagaccacgtgggaaaactaggttgttgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000191636

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064747 lncRNA downstream 117319 30083946 ~ 30085602 (-) True XLOC_032916
TCONS_00065177 lncRNA downstream 342069 29851193 ~ 29860852 (-) True XLOC_032915
TCONS_00065176 lncRNA downstream 354074 29846493 ~ 29848847 (-) True XLOC_032914
TCONS_00065175 lncRNA downstream 354155 29846493 ~ 29848766 (-) False XLOC_032914
TCONS_00065174 lncRNA downstream 354213 29846493 ~ 29848708 (-) False XLOC_032914
TCONS_00063953 lncRNA upstream 18797 30221834 ~ 30221970 (-) True XLOC_032919
TCONS_00065178 lncRNA upstream 249250 30452287 ~ 30456089 (-) False XLOC_032920
TCONS_00065179 lncRNA upstream 249250 30452287 ~ 30459015 (-) True XLOC_032920
TCONS_00063964 lncRNA upstream 652845 30855882 ~ 30868761 (-) True XLOC_032926
TCONS_00063965 lncRNA upstream 866493 31069530 ~ 31147255 (-) True XLOC_032927
TCONS_00063943 mRNA downstream 590652 29476933 ~ 29612269 (-) False XLOC_032909
TCONS_00063947 mRNA downstream 664836 29477812 ~ 29538085 (-) False XLOC_032909
TCONS_00063946 mRNA downstream 664836 29477812 ~ 29538085 (-) False XLOC_032909
TCONS_00063945 mRNA downstream 665702 29477812 ~ 29537219 (-) False XLOC_032909
TCONS_00063944 mRNA downstream 687212 29477812 ~ 29515709 (-) False XLOC_032909
TCONS_00063954 mRNA upstream 280968 30484005 ~ 30485009 (-) True XLOC_032921
TCONS_00063955 mRNA upstream 422908 30625945 ~ 30658848 (-) False XLOC_032922
TCONS_00063956 mRNA upstream 426956 30629993 ~ 30658755 (-) True XLOC_032922
TCONS_00063957 mRNA upstream 473958 30676995 ~ 30683637 (-) True XLOC_032923
TCONS_00063958 mRNA upstream 481659 30684696 ~ 30689126 (-) True XLOC_032924
TCONS_00063938 other downstream 928513 29258238 ~ 29274408 (-) True XLOC_032904
TCONS_00063931 other downstream 1118270 29061650 ~ 29084651 (-) True XLOC_032900
TCONS_00063923 other downstream 1118367 29011911 ~ 29084554 (-) False XLOC_032900
TCONS_00063930 other downstream 1150049 29044997 ~ 29052872 (-) False XLOC_032900
TCONS_00063903 other downstream 3147058 27051342 ~ 27055863 (-) True XLOC_032882
TCONS_00063998 other upstream 2106651 32309688 ~ 32314874 (-) True XLOC_032941
TCONS_00064000 other upstream 2191465 32394502 ~ 32405841 (-) False XLOC_032943
TCONS_00064015 other upstream 3240297 33443334 ~ 33443455 (-) True XLOC_032953
TCONS_00064019 other upstream 3475340 33678377 ~ 33681084 (-) True XLOC_032954
TCONS_00064020 other upstream 3523010 33726047 ~ 33726148 (-) True XLOC_032955