RNA id: TCONS_00063953


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00063953
length 137
lncRNA type lincRNA
GC content 0.31
exon number 1
gene id XLOC_032919
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 30221834 ~ 30221970 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

aaaaaaaaaaattgttgaatgaacatgatttaatcgtggcaccctttatgcatctaatccaatcaaggaaacctgaactgctttgaacatgttgtatgaacacaaagcacatttgtagataatacatggtttcaata

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000155186

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064747 lncRNA downstream 136232 30083946 ~ 30085602 (-) True XLOC_032916
TCONS_00065177 lncRNA downstream 360982 29851193 ~ 29860852 (-) True XLOC_032915
TCONS_00065176 lncRNA downstream 372987 29846493 ~ 29848847 (-) True XLOC_032914
TCONS_00065175 lncRNA downstream 373068 29846493 ~ 29848766 (-) False XLOC_032914
TCONS_00065174 lncRNA downstream 373126 29846493 ~ 29848708 (-) False XLOC_032914
TCONS_00065178 lncRNA upstream 230317 30452287 ~ 30456089 (-) False XLOC_032920
TCONS_00065179 lncRNA upstream 230317 30452287 ~ 30459015 (-) True XLOC_032920
TCONS_00063964 lncRNA upstream 633912 30855882 ~ 30868761 (-) True XLOC_032926
TCONS_00063965 lncRNA upstream 847560 31069530 ~ 31147255 (-) True XLOC_032927
TCONS_00063976 lncRNA upstream 1081350 31303320 ~ 31305958 (-) True XLOC_032929
TCONS_00063950 mRNA downstream 11456 30124197 ~ 30210378 (-) False XLOC_032917
TCONS_00063951 mRNA downstream 11456 30129983 ~ 30210378 (-) True XLOC_032917
TCONS_00063943 mRNA downstream 609565 29476933 ~ 29612269 (-) False XLOC_032909
TCONS_00063947 mRNA downstream 683749 29477812 ~ 29538085 (-) False XLOC_032909
TCONS_00063946 mRNA downstream 683749 29477812 ~ 29538085 (-) False XLOC_032909
TCONS_00063954 mRNA upstream 262035 30484005 ~ 30485009 (-) True XLOC_032921
TCONS_00063955 mRNA upstream 403975 30625945 ~ 30658848 (-) False XLOC_032922
TCONS_00063956 mRNA upstream 408023 30629993 ~ 30658755 (-) True XLOC_032922
TCONS_00063957 mRNA upstream 455025 30676995 ~ 30683637 (-) True XLOC_032923
TCONS_00063958 mRNA upstream 462726 30684696 ~ 30689126 (-) True XLOC_032924
TCONS_00063952 other downstream 18797 30202921 ~ 30203037 (-) True XLOC_032918
TCONS_00063938 other downstream 947426 29258238 ~ 29274408 (-) True XLOC_032904
TCONS_00063931 other downstream 1137183 29061650 ~ 29084651 (-) True XLOC_032900
TCONS_00063923 other downstream 1137280 29011911 ~ 29084554 (-) False XLOC_032900
TCONS_00063930 other downstream 1168962 29044997 ~ 29052872 (-) False XLOC_032900
TCONS_00063998 other upstream 2087718 32309688 ~ 32314874 (-) True XLOC_032941
TCONS_00064000 other upstream 2172532 32394502 ~ 32405841 (-) False XLOC_032943
TCONS_00064015 other upstream 3221364 33443334 ~ 33443455 (-) True XLOC_032953
TCONS_00064019 other upstream 3456407 33678377 ~ 33681084 (-) True XLOC_032954
TCONS_00064020 other upstream 3504077 33726047 ~ 33726148 (-) True XLOC_032955