RNA id: TCONS_00064015


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064015
length 122
RNA type rRNA
GC content 0.46
exon number 1
gene id XLOC_032953
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 33443334 ~ 33443455 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AATGACAGCCATattaccctgcagcccaagactgctTACTCACTGAAGCTTAGCAGGTCTTAGCCTGGTCAGTACTTACAATAGTtggtagaccacatgggaaaactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116019

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00065183 lncRNA downstream 232946 33190582 ~ 33210388 (-) True XLOC_032952
TCONS_00065182 lncRNA downstream 314071 33118841 ~ 33129263 (-) True XLOC_032951
TCONS_00064010 lncRNA downstream 473720 32967396 ~ 32969614 (-) False XLOC_032949
TCONS_00064008 lncRNA downstream 611684 32829516 ~ 32831650 (-) True XLOC_032948
TCONS_00064748 lncRNA downstream 755948 32687002 ~ 32687386 (-) True XLOC_032946
TCONS_00064028 lncRNA upstream 469421 33912876 ~ 33915570 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064029 lncRNA upstream 469421 33912876 ~ 33916720 (-) False XLOC_032957
TCONS_00065184 lncRNA upstream 469421 33912876 ~ 33916722 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064034 lncRNA upstream 475358 33918813 ~ 33921694 (-) False XLOC_032958
TCONS_00065185 lncRNA upstream 540415 33983870 ~ 33984665 (-) True XLOC_032960
TCONS_00064013 mRNA downstream 314022 33104544 ~ 33129312 (-) False XLOC_032951
TCONS_00064014 mRNA downstream 314289 33105630 ~ 33129045 (-) False XLOC_032951
TCONS_00064012 mRNA downstream 367758 33070766 ~ 33075576 (-) True XLOC_032950
TCONS_00064009 mRNA downstream 419589 32966750 ~ 33023745 (-) False XLOC_032949
TCONS_00064011 mRNA downstream 443688 32967570 ~ 32999646 (-) True XLOC_032949
TCONS_00064016 mRNA upstream 220211 33663666 ~ 33871055 (-) False XLOC_032954
TCONS_00064017 mRNA upstream 225118 33668573 ~ 33685325 (-) False XLOC_032954
TCONS_00064018 mRNA upstream 230634 33674089 ~ 33707278 (-) False XLOC_032954
TCONS_00064021 mRNA upstream 431682 33875137 ~ 33878665 (-) False XLOC_032956
TCONS_00064022 mRNA upstream 431837 33875292 ~ 33875919 (-) True XLOC_032956
TCONS_00064000 other downstream 1037493 32394502 ~ 32405841 (-) False XLOC_032943
TCONS_00063998 other downstream 1128460 32309688 ~ 32314874 (-) True XLOC_032941
TCONS_00063952 other downstream 3240297 30202921 ~ 30203037 (-) True XLOC_032918
TCONS_00063938 other downstream 4168926 29258238 ~ 29274408 (-) True XLOC_032904
TCONS_00063931 other downstream 4358683 29061650 ~ 29084651 (-) True XLOC_032900
TCONS_00064019 other upstream 234922 33678377 ~ 33681084 (-) True XLOC_032954
TCONS_00064020 other upstream 282592 33726047 ~ 33726148 (-) True XLOC_032955
TCONS_00064023 other upstream 467699 33911154 ~ 33916702 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064026 other upstream 468734 33912189 ~ 33916660 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064030 other upstream 469732 33913187 ~ 33916714 (-) False XLOC_032957