RNA id: TCONS_00064052


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064052
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_032964
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 34644253 ~ 34644370 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gccagcagctagctctctgaaactcttatatggttgcccactgaagctaagcaggtctgtgccaggtcagtacctggatggggcagtaccacatgggaaagctaggttgctgctagaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120370

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00065186 lncRNA downstream 466355 34158617 ~ 34177898 (-) True XLOC_032962
TCONS_00065185 lncRNA downstream 659588 33983870 ~ 33984665 (-) True XLOC_032960
TCONS_00064034 lncRNA downstream 722559 33918813 ~ 33921694 (-) False XLOC_032958
TCONS_00065184 lncRNA downstream 727531 33912876 ~ 33916722 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064029 lncRNA downstream 727533 33912876 ~ 33916720 (-) False XLOC_032957
TCONS_00065187 lncRNA upstream 5425 34649795 ~ 34652139 (-) True XLOC_032965
TCONS_00064749 lncRNA upstream 172813 34817183 ~ 34818189 (-) True XLOC_032966
TCONS_00065188 lncRNA upstream 207524 34851894 ~ 34860590 (-) True XLOC_032968
TCONS_00064066 lncRNA upstream 302804 34947174 ~ 34954345 (-) False XLOC_032970
TCONS_00065189 lncRNA upstream 302804 34947174 ~ 34957476 (-) False XLOC_032970
TCONS_00064051 mRNA downstream 423612 34213971 ~ 34220641 (-) True XLOC_032963
TCONS_00064050 mRNA downstream 502318 34138386 ~ 34141935 (-) True XLOC_032961
TCONS_00064047 mRNA downstream 635352 33979523 ~ 34008901 (-) False XLOC_032960
TCONS_00064049 mRNA downstream 635374 33983674 ~ 34008879 (-) False XLOC_032960
TCONS_00064048 mRNA downstream 635426 33981496 ~ 34008827 (-) False XLOC_032960
TCONS_00064053 mRNA upstream 179351 34823721 ~ 34838413 (-) False XLOC_032967
TCONS_00064054 mRNA upstream 181384 34825754 ~ 34838397 (-) False XLOC_032967
TCONS_00064058 mRNA upstream 202906 34847276 ~ 34860574 (-) False XLOC_032968
TCONS_00064059 mRNA upstream 287227 34931597 ~ 34938746 (-) False XLOC_032969
TCONS_00064060 mRNA upstream 287230 34931600 ~ 34938678 (-) False XLOC_032969
TCONS_00064031 other downstream 727531 33913366 ~ 33916722 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064030 other downstream 727539 33913187 ~ 33916714 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064032 other downstream 727540 33913795 ~ 33916713 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064023 other downstream 727551 33911154 ~ 33916702 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064026 other downstream 727593 33912189 ~ 33916660 (-) False XLOC_032957
TCONS_00064056 other upstream 182285 34826655 ~ 34832346 (-) False XLOC_032967
TCONS_00064055 other upstream 182285 34826655 ~ 34832346 (-) False XLOC_032967
TCONS_00064057 other upstream 188778 34833148 ~ 34838299 (-) True XLOC_032967
TCONS_00064061 other upstream 287580 34931950 ~ 34938693 (-) False XLOC_032969
TCONS_00064062 other upstream 288253 34932623 ~ 34938707 (-) False XLOC_032969