RNA id: TCONS_00064751


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064751
length 738
lncRNA type inter_gene
GC content 0.34
exon number 2
gene id XLOC_032981
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 36121319 ~ 36124890 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CAACTTTCAAAAAGAATCACTGAATTATCTTCAACACTCATGAATGTATGGGACGTCTATCTTAAACACAAGCATATGTATATATAGCAGGCATGATGTCTGCTAAAAGAAAAAGTAAGCCtttaggagtaaaaaaaaaaaacaataataataactccttTGAACACACAAAGCATTAACATAACCAATTCAAAATCAAATACAAACATCTTAACAGAGAATAAACCAGACAGTCTCAAGAGCCCAAGGACAGAGGAAAAAGTATGCATTATCTTTATAAGTACATAAGGTTAGAGAGATTTAATTACAGAGGTCACTGATTTCAGATACTCAGAAGAAATGTATTGCTTCCAAAAACAGCCCTTTTGGGAATCTAGGGCACTCTGCTGGCGGACATAAACAAgtggaaaaaaaagacaaaaaaaaaggacACTGCTGGGGTAAAAGCTGCATGTGGTCGGCTGGACTTGAGAAAGGCACAAGAAACAATGTCGCAGATACAGCTTTTGCTAAGTATCTTCACAGCCATTTAAAAGGAAGCAAATGTGAACATTTTGTCAAAAGGTAATCCTAAAATAAATGGAGAAAACTAAATgcacaataaaagaaaacaatgaacaaaaaataacctgAAAGTGTTCAGATTACTGAAATGACTGATTATTGTTTCAGAGATGCCACAAATTATGACAGCTCAACTATTGACTCAACCATAAGGGTAAGAAACTATTTTGATGC

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064090 lncRNA downstream 206606 35910498 ~ 35914713 (-) False XLOC_032980
TCONS_00064088 lncRNA downstream 206610 35910498 ~ 35914709 (-) False XLOC_032980
TCONS_00064087 lncRNA downstream 206610 35910498 ~ 35914709 (-) False XLOC_032980
TCONS_00065191 lncRNA downstream 206855 35913701 ~ 35914464 (-) True XLOC_032980
TCONS_00064089 lncRNA downstream 206909 35911525 ~ 35914410 (-) False XLOC_032980
TCONS_00064095 lncRNA upstream 162648 36287538 ~ 36290625 (-) False XLOC_032983
TCONS_00064096 lncRNA upstream 162981 36287871 ~ 36289861 (-) False XLOC_032983
TCONS_00065192 lncRNA upstream 162996 36287886 ~ 36289874 (-) True XLOC_032983
TCONS_00065193 lncRNA upstream 261402 36386292 ~ 36393495 (-) True XLOC_032984
TCONS_00064099 lncRNA upstream 426846 36551736 ~ 36552747 (-) True XLOC_032986
TCONS_00064085 mRNA downstream 341971 35675784 ~ 35779348 (-) False XLOC_032978
TCONS_00064086 mRNA downstream 382483 35675874 ~ 35738836 (-) True XLOC_032978
TCONS_00064082 mRNA downstream 633139 35459369 ~ 35488180 (-) False XLOC_032977
TCONS_00064083 mRNA downstream 633906 35461631 ~ 35487413 (-) False XLOC_032977
TCONS_00064084 mRNA downstream 648396 35462347 ~ 35472923 (-) True XLOC_032977
TCONS_00064092 mRNA upstream 2615 36127505 ~ 36198052 (-) False XLOC_032982
TCONS_00064093 mRNA upstream 6141 36131031 ~ 36182115 (-) False XLOC_032982
TCONS_00064098 mRNA upstream 426193 36551083 ~ 36552844 (-) False XLOC_032986
TCONS_00064102 mRNA upstream 593095 36717985 ~ 36795219 (-) False XLOC_032988
TCONS_00064101 mRNA upstream 593095 36717985 ~ 36795219 (-) False XLOC_032988
TCONS_00064091 other downstream 207812 35912621 ~ 35913507 (-) False XLOC_032980
TCONS_00064062 other downstream 1182612 34932623 ~ 34938707 (-) False XLOC_032969
TCONS_00064061 other downstream 1182626 34931950 ~ 34938693 (-) False XLOC_032969
TCONS_00064094 other upstream 53455 36178345 ~ 36197764 (-) True XLOC_032982
TCONS_00064097 other upstream 354303 36479193 ~ 36502330 (-) True XLOC_032985
TCONS_00064104 other upstream 608819 36733709 ~ 36733826 (-) True XLOC_032989
TCONS_00064105 other upstream 619244 36744134 ~ 36744251 (-) True XLOC_032990
TCONS_00064106 other upstream 645049 36769939 ~ 36770069 (-) True XLOC_032991

Expression Profile

//